More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01579 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01579  Response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like protein  100 
 
 		 891 aa  1815    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3723  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.94 
 
 		 903 aa  731    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.803649  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.94 
 
 		 1005 aa  340  8e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.03 
 
 		 1165 aa  332  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 		 1267 aa  327  5e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3344  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.85 
 
 		 1390 aa  327  5e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 		 920 aa  325  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 		 833 aa  324  4e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.78 
 
 		 2213 aa  323  6e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.43 
 
 		 1230 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  37.11 
 
 		 1763 aa  320  9e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 		 1234 aa  319  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 		 909 aa  319  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  38.53 
 
 		 1287 aa  318  4e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  37.62 
 
 		 1200 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  37.74 
 
 		 1030 aa  315  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1245 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 		 1303 aa  314  4.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.71 
 
 		 1340 aa  313  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 		 1313 aa  311  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0067  signal transduction histidine kinase-like protein protein  37.22 
 
 		 1021 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  36.83 
 
 		 1214 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 		 1767 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 		 1767 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 		 1238 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  36.96 
 
 		 1236 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  36.41 
 
 		 1683 aa  308  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 		 1193 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 		 1234 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 		 1202 aa  309  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.85 
 
 		 1238 aa  308  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 		 1236 aa  308  3e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 		 1236 aa  308  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 		 1236 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.85 
 
 		 1238 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 		 1040 aa  307  5.0000000000000004e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.43 
 
 		 1442 aa  307  6e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.77 
 
 		 1771 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.48 
 
 		 1238 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.26 
 
 		 1128 aa  303  8.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.62 
 
 		 1331 aa  303  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4645  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 		 948 aa  302  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 		 1236 aa  302  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 		 993 aa  301  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 		 1251 aa  300  8e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2818  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.64 
 
 		 720 aa  299  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.215558  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.1 
 
 		 1009 aa  298  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 		 782 aa  298  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  34.57 
 
 		 923 aa  298  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  36.04 
 
 		 1574 aa  297  7e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  37.19 
 
 		 1177 aa  296  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 1310 aa  295  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  33.18 
 
 		 778 aa  293  9e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 1240 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.27 
 
 		 770 aa  293  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 1316 aa  292  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0066  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 		 721 aa  291  5.0000000000000004e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 		 1691 aa  291  5.0000000000000004e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0139  histidine kinase  34.02 
 
 		 1064 aa  290  7e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 990 aa  290  8e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  31.9 
 
 		 1014 aa  290  9e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 		 912 aa  290  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 		 991 aa  288  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4002  sensory transduction histidine kinase  35.7 
 
 		 1689 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0316  response regulator, histidine kinase  33.27 
 
 		 891 aa  288  2.9999999999999996e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.43 
 
 		 1233 aa  288  5e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  31.84 
 
 		 932 aa  286  9e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 		 705 aa  286  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15460  membrane sensor hybrid histidine protein kinase  34.58 
 
 		 772 aa  286  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.361903  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2105  PAS  33.58 
 
 		 680 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.292551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.21 
 
 		 1109 aa  286  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  31.44 
 
 		 918 aa  285  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  31.44 
 
 		 918 aa  285  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 		 918 aa  284  6.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.44 
 
 		 918 aa  284  6.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.44 
 
 		 918 aa  284  6.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.44 
 
 		 918 aa  284  6.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.44 
 
 		 918 aa  284  6.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.44 
 
 		 918 aa  284  6.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.44 
 
 		 918 aa  284  6.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003637  hypothetical protein  35.6 
 
 		 1055 aa  283  7.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 		 1560 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  36.36 
 
 		 786 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  33.51 
 
 		 1653 aa  282  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 		 1426 aa  282  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 		 929 aa  282  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3595  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 		 744 aa  281  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 		 738 aa  281  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 		 1260 aa  281  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2911  Signal transduction histidine kinase-like  33.5 
 
 		 614 aa  281  4e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.522468 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0463  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 		 1314 aa  281  4e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332875  normal  0.985136 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 		 1659 aa  281  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 914 aa  279  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2940  PAS  36.42 
 
 		 1353 aa  280  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2370  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 		 899 aa  280  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382891  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1782  sensor histidine kinase/response regulator  31.84 
 
 		 783 aa  279  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.54 
 
 		 933 aa  278  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 		 921 aa  278  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3174  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 		 1087 aa  276  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134389 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.4 
 
 		 858 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.432629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>