More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1885 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 792 aa  1600    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3040  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  43.55 
 
 		 815 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1003  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  46.55 
 
 		 879 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.528155 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0891  adenylate/guanylate cyclase  45.96 
 
 		 822 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0561  putative adenylate/guanylate cyclase  44.51 
 
 		 817 aa  429  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 873 aa  333  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00758089  normal  0.057217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 		 680 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.2 
 
 		 1479 aa  231  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  32.07 
 
 		 1361 aa  230  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 1877 aa  230  9e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0606  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 785 aa  218  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0666  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 		 1400 aa  217  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.982341 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 		 1362 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 		 823 aa  212  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 		 1214 aa  208  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0055  sensor protein  32.55 
 
 		 717 aa  208  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.782355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 		 975 aa  206  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4049  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.36 
 
 		 1406 aa  206  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 1406 aa  205  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.37 
 
 		 1135 aa  204  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1586  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 442 aa  203  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1611  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 442 aa  203  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.59 
 
 		 687 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 974 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 1468 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 		 1857 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 1274 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.87 
 
 		 1964 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 		 1782 aa  196  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.55 
 
 		 906 aa  196  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  43.4 
 
 		 508 aa  196  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 970 aa  195  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 		 827 aa  195  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.69 
 
 		 646 aa  194  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 1839 aa  194  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.77 
 
 		 880 aa  193  9e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.49 
 
 		 1816 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.22 
 
 		 1195 aa  192  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  32.06 
 
 		 576 aa  192  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.38 
 
 		 1352 aa  192  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 		 1792 aa  192  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.72 
 
 		 977 aa  191  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 456 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  45.85 
 
 		 565 aa  191  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  43.93 
 
 		 729 aa  191  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 371 aa  191  7e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1561  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  46.32 
 
 		 443 aa  190  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3328  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.11 
 
 		 1482 aa  190  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.48 
 
 		 717 aa  190  9e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  40.55 
 
 		 1046 aa  189  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.79 
 
 		 1550 aa  189  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2387  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.22 
 
 		 604 aa  189  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179199  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 		 763 aa  189  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0144  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 		 1119 aa  188  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 		 1303 aa  188  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 		 490 aa  188  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  44.09 
 
 		 1200 aa  187  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.98 
 
 		 780 aa  187  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 		 2099 aa  187  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.22 
 
 		 1127 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 		 754 aa  186  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  44.54 
 
 		 1137 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 		 844 aa  186  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.47 
 
 		 1201 aa  186  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.3 
 
 		 1159 aa  186  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 		 1896 aa  185  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  42.62 
 
 		 461 aa  185  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  45.45 
 
 		 792 aa  185  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.45 
 
 		 803 aa  185  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  42.62 
 
 		 461 aa  185  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.29 
 
 		 765 aa  185  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 		 1319 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.19 
 
 		 497 aa  185  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  29.95 
 
 		 1695 aa  185  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  42.15 
 
 		 461 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  42.51 
 
 		 1346 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.57 
 
 		 844 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.83 
 
 		 1942 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.57 
 
 		 844 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  40.33 
 
 		 1119 aa  184  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.06 
 
 		 1143 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  43.35 
 
 		 968 aa  184  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 		 984 aa  184  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  42.74 
 
 		 923 aa  184  8.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 1159 aa  184  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 		 1022 aa  183  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.77 
 
 		 1155 aa  183  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 		 699 aa  183  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.57 
 
 		 917 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  45 
 
 		 1168 aa  183  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.7 
 
 		 1193 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0496  histidine kinase  43.75 
 
 		 554 aa  183  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434752 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3217  ATP-binding region ATPase domain protein  38.38 
 
 		 576 aa  182  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.644054  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0066  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.35 
 
 		 721 aa  182  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4523  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 1179 aa  182  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522992  decreased coverage  0.00180703 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.41 
 
 		 1158 aa  182  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 		 1207 aa  182  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.7 
 
 		 1193 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.12 
 
 		 1137 aa  182  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  44.59 
 
 		 2035 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>