More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3871 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3871  putative sensor histidine kinase  100 
 
 
788 aa  1596    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3384  Signal transduction histidine kinase-like  26.97 
 
 
761 aa  170  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0602  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  21.12 
 
 
1057 aa  105  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862038  hitchhiker  0.00157552 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2645  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  22.75 
 
 
1093 aa  100  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4348  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  26.22 
 
 
1215 aa  94.7  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4144  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  26.7 
 
 
1215 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4216  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  26.46 
 
 
1215 aa  91.7  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.78 
 
 
1285 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3784  putative sensory transduction system, regulatory protein  29.58 
 
 
549 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3856  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  21.47 
 
 
1216 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4656.2  hypothetical protein  24.46 
 
 
673 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.01 
 
 
1721 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3821  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  22.65 
 
 
1209 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0235394 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0798  diguanylate cyclase  26.07 
 
 
550 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3912  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  22.65 
 
 
1209 aa  82  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4029  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  22.88 
 
 
1228 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.63 
 
 
1322 aa  80.5  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.18 
 
 
929 aa  79.3  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.72 
 
 
1090 aa  79  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.72 
 
 
1090 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.14 
 
 
764 aa  77.4  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.39 
 
 
922 aa  76.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.67 
 
 
1068 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
846 aa  75.9  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.52 
 
 
969 aa  75.5  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0605  histidine kinase  30.08 
 
 
1190 aa  75.1  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.3 
 
 
1058 aa  75.1  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  27.92 
 
 
984 aa  74.3  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.1 
 
 
844 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.1 
 
 
844 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3783  sensory transduction system, regulatory protein  23.39 
 
 
546 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.11 
 
 
927 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  27.71 
 
 
932 aa  73.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0688  histidine kinase/response regulator hybrid protein  29.27 
 
 
1179 aa  72.8  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.14 
 
 
933 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0082  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 
866 aa  72.4  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0375698  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0799  diguanylate cyclase  21.41 
 
 
538 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0186826  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0528  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.93 
 
 
926 aa  72.4  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178759  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.16 
 
 
1358 aa  72  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.4 
 
 
932 aa  72  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.15 
 
 
950 aa  72  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.12 
 
 
937 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  20.43 
 
 
1002 aa  71.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1582  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 
788 aa  71.2  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.24 
 
 
717 aa  71.2  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.48 
 
 
1044 aa  71.2  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3457  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.14 
 
 
935 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  20.43 
 
 
1002 aa  70.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.14 
 
 
935 aa  71.2  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.715392 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.14 
 
 
935 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.09 
 
 
1352 aa  70.9  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
957 aa  70.9  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  26.63 
 
 
914 aa  70.5  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.14 
 
 
935 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  23.16 
 
 
909 aa  69.7  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.86 
 
 
1578 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  25.36 
 
 
777 aa  69.3  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.55 
 
 
1596 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.86 
 
 
1611 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.95 
 
 
933 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  24.79 
 
 
1121 aa  69.3  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.95 
 
 
933 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  24.07 
 
 
810 aa  68.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.95 
 
 
933 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.95 
 
 
932 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.97 
 
 
1452 aa  68.6  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2430  histidine kinase  24.44 
 
 
629 aa  68.2  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.73405  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01227  two-component hybrid sensor and regulator  26.51 
 
 
699 aa  68.2  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.13 
 
 
1240 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  24.12 
 
 
929 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2222  diguanylate cyclase  24.32 
 
 
847 aa  67.4  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.162543  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.26 
 
 
673 aa  67.4  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 
574 aa  67.4  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.15 
 
 
952 aa  67.4  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.1 
 
 
1237 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.33 
 
 
1005 aa  66.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1490  secretion system regulator:Sensor component  24.54 
 
 
920 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.490223 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1779  secretion system regulator:Sensor component  24.54 
 
 
920 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.255044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.06 
 
 
770 aa  66.6  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3550  hybrid sensory histidine kinase BarA  25.84 
 
 
928 aa  65.9  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3391  hybrid sensory histidine kinase BarA  25.84 
 
 
931 aa  65.9  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.44 
 
 
653 aa  65.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.1 
 
 
1611 aa  65.9  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4371  histidine kinase  22.37 
 
 
589 aa  65.5  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.948741 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  26 
 
 
1165 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.51 
 
 
941 aa  65.5  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.73 
 
 
939 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.97 
 
 
1143 aa  65.1  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01690  histidine kinase-response regulator hybrid protein  27.15 
 
 
1191 aa  65.1  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.48 
 
 
913 aa  65.1  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1949  secretion system regulator:Sensor component  24.16 
 
 
920 aa  64.7  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.14133  normal  0.0293966 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  27.62 
 
 
1028 aa  64.7  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.57 
 
 
937 aa  64.7  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1505  secretion system regulator:Sensor component  24.16 
 
 
920 aa  64.7  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000630125 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1527  secretion system regulator:Sensor component  24.16 
 
 
920 aa  64.7  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0140135 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
968 aa  64.7  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  26.12 
 
 
794 aa  64.7  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1434  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.46 
 
 
1186 aa  64.3  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  24.54 
 
 
977 aa  64.7  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.17 
 
 
982 aa  64.3  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.288363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>