More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4371 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4371  histidine kinase  100 
 
 		 589 aa  1179    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.948741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.41 
 
 		 595 aa  556  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00296366  normal  0.187641 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  37.89 
 
 		 729 aa  334  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  33.33 
 
 		 735 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  31.95 
 
 		 858 aa  243  9e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.88 
 
 		 738 aa  223  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3852  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 879 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0452097  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1377  Cache sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 		 731 aa  209  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 		 864 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3308  sensor histidine kinase  45.61 
 
 		 845 aa  203  9e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.67 
 
 		 880 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 919 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.46 
 
 		 917 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  43.43 
 
 		 925 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.29 
 
 		 785 aa  198  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.46 
 
 		 917 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  43.03 
 
 		 925 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.06 
 
 		 917 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.65 
 
 		 916 aa  196  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1877  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.44 
 
 		 863 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  41.83 
 
 		 952 aa  194  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  41.43 
 
 		 933 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  41.43 
 
 		 933 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  41.43 
 
 		 933 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  40.57 
 
 		 918 aa  193  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.06 
 
 		 1313 aa  193  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  41.43 
 
 		 932 aa  193  8e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  40.57 
 
 		 918 aa  193  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  40.57 
 
 		 918 aa  193  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  40.57 
 
 		 918 aa  193  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  45.83 
 
 		 823 aa  193  9e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  40.57 
 
 		 918 aa  193  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  40.16 
 
 		 918 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 		 918 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3457  hybrid sensory histidine kinase BarA  41.83 
 
 		 935 aa  192  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  40.4 
 
 		 937 aa  192  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  40.16 
 
 		 918 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.06 
 
 		 922 aa  192  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  40.16 
 
 		 918 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 620 aa  192  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  40.16 
 
 		 918 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  40.16 
 
 		 918 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  40.16 
 
 		 918 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  40.16 
 
 		 918 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  40.16 
 
 		 918 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  40.16 
 
 		 918 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  36.75 
 
 		 1763 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  45.27 
 
 		 661 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  45.37 
 
 		 1203 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  41.83 
 
 		 935 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2225  histidine kinase  38.65 
 
 		 845 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0086849  normal  0.197777 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0511  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 		 490 aa  190  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000039961  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2163  histidine kinase  38.65 
 
 		 845 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.35 
 
 		 870 aa  190  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 		 646 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.95 
 
 		 830 aa  190  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.64 
 
 		 882 aa  190  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  41.43 
 
 		 933 aa  189  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  42.46 
 
 		 917 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.2 
 
 		 932 aa  189  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.16 
 
 		 850 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.78 
 
 		 969 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.59 
 
 		 1406 aa  188  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  41.43 
 
 		 950 aa  189  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  41.43 
 
 		 935 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715392 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  41.43 
 
 		 935 aa  189  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  45.38 
 
 		 764 aa  188  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  42.57 
 
 		 982 aa  187  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  42.06 
 
 		 917 aa  187  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  36.82 
 
 		 732 aa  187  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 		 1765 aa  187  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 1767 aa  187  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 		 1172 aa  187  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  42.52 
 
 		 905 aa  187  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 1767 aa  187  7e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 		 791 aa  186  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 		 995 aa  186  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  41.94 
 
 		 942 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  40.4 
 
 		 937 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.32 
 
 		 780 aa  186  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.25 
 
 		 1767 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0210  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.67 
 
 		 708 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.9 
 
 		 1479 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  41.8 
 
 		 810 aa  184  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.45 
 
 		 713 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 1193 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3075  histidine kinase  44.35 
 
 		 550 aa  184  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 1193 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.53 
 
 		 827 aa  183  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.98 
 
 		 1145 aa  183  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.56 
 
 		 968 aa  183  7e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  41.43 
 
 		 941 aa  183  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.31 
 
 		 948 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  38.46 
 
 		 1765 aa  182  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.85 
 
 		 929 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.39 
 
 		 1771 aa  182  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  42.55 
 
 		 853 aa  182  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0973  histidine kinase  30.18 
 
 		 733 aa  182  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000797186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.29 
 
 		 1611 aa  182  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.69 
 
 		 1143 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>