More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0511 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0511  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
490 aa  1004    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000039961  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.39 
 
 
902 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.38 
 
 
1363 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 
1069 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 
1369 aa  234  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  45.35 
 
 
968 aa  232  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.7 
 
 
896 aa  227  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.5 
 
 
767 aa  227  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.78 
 
 
816 aa  227  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  46.84 
 
 
932 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.8 
 
 
1767 aa  226  8e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.8 
 
 
1767 aa  226  9e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  46.84 
 
 
932 aa  225  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0974  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.23 
 
 
916 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.84 
 
 
919 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.28 
 
 
1765 aa  224  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.75 
 
 
1442 aa  224  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 
765 aa  224  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  45.02 
 
 
1765 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.26 
 
 
1245 aa  223  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 
738 aa  223  8e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  45.15 
 
 
927 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  46.41 
 
 
929 aa  222  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  46.67 
 
 
950 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.07 
 
 
1767 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.11 
 
 
1331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  46.67 
 
 
925 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.13 
 
 
916 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  42.95 
 
 
631 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  43.11 
 
 
1346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.58 
 
 
882 aa  221  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.27 
 
 
1792 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.14 
 
 
2213 aa  220  5e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.06 
 
 
1771 aa  220  6e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.27 
 
 
1784 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.27 
 
 
1786 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.27 
 
 
1782 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  44.4 
 
 
1763 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.77 
 
 
1313 aa  218  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.55 
 
 
718 aa  219  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.7 
 
 
919 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  43.51 
 
 
917 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.28 
 
 
1768 aa  218  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 
1326 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  36.36 
 
 
982 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.37 
 
 
977 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.74 
 
 
1267 aa  217  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  43.51 
 
 
917 aa  217  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  43.57 
 
 
661 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.27 
 
 
917 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
957 aa  216  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.49 
 
 
917 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.91 
 
 
724 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  45.22 
 
 
735 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  46.59 
 
 
2035 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1767  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.44 
 
 
1157 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2015  putative PAS/PAC sensor protein  34.72 
 
 
1119 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000673901 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.28 
 
 
1287 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 
920 aa  214  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  46.44 
 
 
1407 aa  214  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.83 
 
 
1310 aa  214  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  45.11 
 
 
906 aa  214  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  45.82 
 
 
905 aa  213  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.87 
 
 
936 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.87 
 
 
917 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2452  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.98 
 
 
1177 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.97 
 
 
922 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  44.06 
 
 
544 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 
1040 aa  212  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  39.93 
 
 
923 aa  212  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.77 
 
 
918 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 
940 aa  212  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.88 
 
 
956 aa  212  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  41.91 
 
 
918 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.91 
 
 
918 aa  212  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  41.91 
 
 
918 aa  212  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  41.91 
 
 
918 aa  212  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  41.91 
 
 
918 aa  212  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.15 
 
 
1340 aa  212  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.77 
 
 
918 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  41.91 
 
 
918 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  41.91 
 
 
918 aa  212  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.77 
 
 
918 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  41.91 
 
 
918 aa  212  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  41.91 
 
 
918 aa  212  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  46.05 
 
 
942 aa  212  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.77 
 
 
918 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.77 
 
 
918 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2282  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.21 
 
 
685 aa  211  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  38.1 
 
 
1135 aa  211  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.2 
 
 
916 aa  210  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.48 
 
 
1305 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 
874 aa  210  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  39.54 
 
 
935 aa  210  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0616  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.12 
 
 
766 aa  210  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0116444 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.46 
 
 
1255 aa  210  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  43.27 
 
 
666 aa  210  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1887  transmission sensor LetS  40.3 
 
 
910 aa  210  6e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  45.92 
 
 
950 aa  210  6e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.42 
 
 
645 aa  210  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>