More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1399 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1399  two component sensor histidine kinase  100 
 
 
565 aa  1170    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0979  two component sensor histidine kinase  37.92 
 
 
550 aa  347  4e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.325763  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
677 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 
1017 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  28.77 
 
 
1629 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 
584 aa  150  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 
711 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
1014 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 
1060 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 
584 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 
719 aa  144  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.688425  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
637 aa  144  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.34 
 
 
1279 aa  140  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 
885 aa  140  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 
958 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.96 
 
 
508 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.04 
 
 
1322 aa  137  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  26.84 
 
 
537 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3102  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 
1211 aa  136  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.07 
 
 
933 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 
610 aa  135  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  26.46 
 
 
587 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  26.06 
 
 
587 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  26.46 
 
 
587 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 
1042 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  26.06 
 
 
587 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
758 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0485  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.68 
 
 
726 aa  131  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0662755 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5362  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 
643 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 
1039 aa  131  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.27 
 
 
813 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 
585 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 
1043 aa  130  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  28.57 
 
 
762 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  26.23 
 
 
587 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  26.23 
 
 
587 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  26.23 
 
 
587 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  31.1 
 
 
617 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.01 
 
 
611 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 
725 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  26.64 
 
 
587 aa  128  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
546 aa  128  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  26.64 
 
 
587 aa  128  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  23.23 
 
 
613 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 
619 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
1026 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2503  ATP-binding region ATPase domain protein  25.74 
 
 
586 aa  127  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626629  normal  0.221976 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 
612 aa  126  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 
511 aa  126  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0857  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 
698 aa  126  9e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0897898 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 
905 aa  126  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1630  sensory box histidine kinase  25.92 
 
 
710 aa  126  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00580838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 
587 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  26.56 
 
 
581 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 
722 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 
509 aa  125  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  25.34 
 
 
581 aa  124  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  31.91 
 
 
1111 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 
754 aa  124  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3109  sensor protein  34.03 
 
 
485 aa  123  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 
880 aa  123  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.34 
 
 
555 aa  123  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 
585 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 
589 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 
581 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
911 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 
592 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3611  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 
566 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.716129  hitchhiker  0.000346414 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
755 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1945  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23 
 
 
690 aa  121  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000961188  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.81 
 
 
944 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0008  sensory box histidine kinase/response regulator  24.56 
 
 
516 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 
556 aa  121  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3370  PAS sensor protein  24.72 
 
 
713 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277761  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 
600 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 
581 aa  120  7e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 
571 aa  120  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 
2161 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  22 
 
 
621 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  23.23 
 
 
613 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 
590 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 
884 aa  118  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 
763 aa  118  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.508031  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0604  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
1174 aa  118  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.42995  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
2153 aa  118  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0053  two component sensor histidine kinase  26.86 
 
 
867 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 
556 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 
718 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 
1291 aa  117  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
639 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  23.01 
 
 
613 aa  117  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  23.01 
 
 
613 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  23.01 
 
 
613 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  23.01 
 
 
613 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  23.01 
 
 
613 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 
1207 aa  117  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.48 
 
 
609 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.63 
 
 
582 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  23.01 
 
 
613 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 
421 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>