More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3337 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3337  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  241  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3080  response regulator receiver protein  98.33 
 
 		 120 aa  238  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.425562 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2607  response regulator receiver protein  68.33 
 
 		 120 aa  169  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3528  two component response regulator  65.55 
 
 		 119 aa  160  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1570  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 127 aa  89.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0526  chemotaxis protein cheY  35.65 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0660  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.711341 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0522  CheY protein  33.91 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.757769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3676  response regulator receiver  34.78 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3374  response regulator receiver domain-containing protein  34.78 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3918  response regulator receiver domain-containing protein  34.78 
 
 		 121 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.734494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6557  chemotaxis protein cheY  34.78 
 
 		 121 aa  86.7  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4245  response regulator receiver domain-containing protein  34.78 
 
 		 121 aa  87  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4033  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal  0.596674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1819  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2212  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0067  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0522  response regulator receiver domain-containing protein  33.91 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1712  response regulator receiver protein  34.86 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.599884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4836  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.0072817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0096  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1693  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 121 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26323  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1811  response regulator receiver protein  33.03 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000108366  normal  0.182528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1531  response regulator receiver  33.03 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0584637 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1738  response regulator receiver protein  31.19 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0418251 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1534  putative chemotaxis protein cheY  26.55 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.358935 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  30.63 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2686  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  29.82 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3328  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.53 
 
 		 711 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6678  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.03 
 
 		 318 aa  54.7  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 1390 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1910  response regulator receiver  28.07 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0109911  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 1390 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 1390 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4159  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0843  response regulator receiver protein  31.48 
 
 		 251 aa  53.5  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000594696  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  29.52 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4047  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.772934  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  28.32 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  29.57 
 
 		 129 aa  52.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0246  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  34.29 
 
 		 469 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.487777  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  30.48 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  29.52 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2710  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.04 
 
 		 704 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325078 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1409  putative chemotaxis response regulator transcription regulator protein  32.17 
 
 		 137 aa  52  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0880  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  29.52 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  29.52 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  29.2 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1722  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  28.18 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  28.18 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  29.52 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1261  nitrogen assimilation regulatory response regulator transcription regulator protein  33.64 
 
 		 502 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.634694  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2939  response regulator receiver protein  30.19 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 394 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1787  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.860265  normal  0.648843 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  31.73 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2142  two component transcriptional regulator  29.46 
 
 		 240 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  28.32 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0180  response regulator receiver protein  32.38 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1525  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.91 
 
 		 316 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.15223e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1506  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.1 
 
 		 704 aa  51.2  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  27.62 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  27.27 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  28.32 
 
 		 121 aa  50.8  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 1631 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  27.27 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  28.57 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2191  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0766  two component transcriptional regulator  32.69 
 
 		 233 aa  50.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.528482  normal  0.302775 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  29.52 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  29.52 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1089  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  33.64 
 
 		 502 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  29.52 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 1002 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  29.52 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 120 aa  50.4  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  28.57 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  27.52 
 
 		 806 aa  50.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  29.2 
 
 		 123 aa  50.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01717  putative response regulator  31.25 
 
 		 568 aa  50.4  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>