More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1910 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1910  response regulator receiver  100 
 
 		 122 aa  251  3e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0109911  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3676  response regulator receiver  53.28 
 
 		 121 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0660  response regulator receiver protein  49.18 
 
 		 124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.711341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1819  response regulator receiver protein  51.64 
 
 		 121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0526  chemotaxis protein cheY  53.66 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4245  response regulator receiver domain-containing protein  52.85 
 
 		 121 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3918  response regulator receiver domain-containing protein  50.82 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.734494 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3374  response regulator receiver domain-containing protein  50 
 
 		 121 aa  123  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0522  CheY protein  49.18 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.757769 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4033  response regulator receiver protein  51.24 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal  0.596674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6557  chemotaxis protein cheY  50 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0096  response regulator receiver protein  50 
 
 		 121 aa  121  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0067  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 122 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0522  response regulator receiver domain-containing protein  47.97 
 
 		 123 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4836  response regulator receiver protein  48.36 
 
 		 121 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.0072817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1693  response regulator receiver protein  47.54 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26323  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1712  response regulator receiver protein  45.08 
 
 		 137 aa  107  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.599884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1531  response regulator receiver  47.11 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0584637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1811  response regulator receiver protein  47.11 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000108366  normal  0.182528 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30890  response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain  41.88 
 
 		 123 aa  103  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1787  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.860265  normal  0.648843 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  42.11 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1738  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0418251 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  40.5 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2000  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 127 aa  99.4  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0323  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47332  normal  0.784994 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  40.87 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  40.5 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  40.5 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  41.23 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  39.47 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 130 aa  95.9  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1527  response regulator receiver protein, CheY  41.18 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.439374 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 126 aa  93.2  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  39.47 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0843  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 251 aa  92  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000594696  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3597  response regulator receiver  42.11 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.593554  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 127 aa  90.1  9e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5001  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2319  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  41.74 
 
 		 130 aa  89.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  41.74 
 
 		 130 aa  89.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2489  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 385 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2479  response regulator receiver protein  41.28 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.591075  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2575  response regulator receiver protein  41.28 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0149684  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2585  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 385 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  41.23 
 
 		 126 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1368  response regulator receiver domain-containing protein  42.24 
 
 		 386 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 139 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 126 aa  87.4  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  40 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  42.11 
 
 		 131 aa  87  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  40.35 
 
 		 128 aa  87  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  41.23 
 
 		 127 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  39.47 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  40.35 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  40.35 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  39.13 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2874  response regulator receiver  45.61 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3583  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  41.23 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  41.23 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 129 aa  84.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  39.45 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1456  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  41.23 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  40.35 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  37.39 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  38.6 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 128 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 131 aa  83.6  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  39.47 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  39.47 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>