More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0965 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0965  response regulator receiver protein  100 
 
 		 128 aa  261  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00737627  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1967  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0246648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0150  response regulator receiver protein  39.68 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  0.0737587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2709  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 135 aa  83.6  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.755164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0217  response regulator receiver protein  40.95 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3302  chemotaxis response regulator, CheY4  38.52 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4035  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3183  chemotaxis response regulator  38.39 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.81 
 
 		 508 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3298  hypothetical protein  36.84 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.765394 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  40 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2539  response regulator receiver protein  36.56 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.745401  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0403  chemotaxis protein CheY  33.05 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.286627  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3119  response regulator receiver domain-containing protein  32.17 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  35.9 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  37.96 
 
 		 220 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1842  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  32.74 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2317  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  36.07 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1773  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.894508  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2006  response regulator receiver  39.81 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.379718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  40 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1500  flagellar regulatory protein C  35.09 
 
 		 446 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0229  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.51 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.069189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2139  response regulator receiver  34.23 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  35.04 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  36.07 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  34.82 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2880  two component transcriptional regulator  32.14 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21520  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.2 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0794896  hitchhiker  0.0000630157 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.86 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3937  chemotaxis protein CheY  38.39 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450944  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1683  chemotaxis response regulator  38.39 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.058459  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2860  chemotaxis response regulator  38.39 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0078  chemotaxis two-component response regulator CheY1  38.39 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.51 
 
 		 513 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3115  chemotaxis response regulator  38.39 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0317  two component transcriptional regulator  30.08 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3856  chemotaxis protein CheY  38.39 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.119201  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  37.04 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 511 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3419  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3436  chemotaxis response regulator  38.39 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.487873  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.04 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  34.75 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.93 
 
 		 256 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 		 260 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2944  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.95 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  0.70587 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1583  chemotaxis response regulator, CheY3  31.58 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00144899  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.26 
 
 		 235 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0263  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.419062 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.26 
 
 		 236 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0679  response regulator receiver  38.39 
 
 		 337 aa  64.3  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0836964  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1566  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.34 
 
 		 228 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435599 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0235  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3146  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.19 
 
 		 218 aa  63.9  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.149495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4113  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0232733  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  33.93 
 
 		 228 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  35.04 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2599  two component transcriptional regulator  37.96 
 
 		 232 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0886  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 207 aa  63.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3502  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.96 
 
 		 232 aa  63.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1802  response regulator receiver protein  32 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5036  response regulator receiver  33.33 
 
 		 294 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.118598 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4258  response regulator receiver  35.04 
 
 		 220 aa  63.5  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3603  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.656399  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  35.19 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5482  response regulator  33.33 
 
 		 297 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.420057  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  34.13 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  34.43 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3680  response regulator receiver domain-containing protein  47.19 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.383377  normal  0.047176 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.45 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  38.94 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.11 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0184  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2975  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2784  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0945133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  38.94 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  38.94 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  34.78 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  38.05 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1803  two component transcriptional regulator  35.2 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782093  normal  0.890279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  38.2 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5704  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  38.94 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>