More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0150 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0150  response regulator receiver protein  100 
 
 		 141 aa  288  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  0.0737587 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1967  response regulator receiver protein  45.08 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0246648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2709  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 135 aa  120  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.755164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0965  response regulator receiver protein  39.68 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00737627  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.14 
 
 		 220 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  36.51 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  36.51 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3669  response regulator receiver protein  36 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  33.88 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  37.4 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  35.71 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.81 
 
 		 235 aa  74.7  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3076  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.78 
 
 		 454 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  34.88 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21520  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.43 
 
 		 222 aa  74.3  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0794896  hitchhiker  0.0000630157 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.9 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4041  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  34.88 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  35.71 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  36.51 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  36.51 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1581  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  35.48 
 
 		 223 aa  73.9  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 220 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1641  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.0712727 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  36.43 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  32.52 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  32.48 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  35.66 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  35.66 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  33.9 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  37.4 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.75 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3012  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.9 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  35.66 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  34.68 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3033  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.190199 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  34.75 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1566  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.65 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435599 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  36.43 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  37.3 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.88 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.88 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  37.21 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1320  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  31.2 
 
 		 460 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  38.14 
 
 		 220 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3092  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0904  two component Fis family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 454 aa  72  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4351  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.71 
 
 		 229 aa  72  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.997672  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1183  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 228 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  35.66 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.23 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  32.79 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2073  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.847769  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 220 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0142  DNA-binding response regulator  33.06 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 391 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.17 
 
 		 230 aa  71.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 390 aa  71.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.19 
 
 		 223 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0247  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 407 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.433647 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  35.59 
 
 		 224 aa  71.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0682  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.45 
 
 		 243 aa  70.5  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2942  response regulator  31.69 
 
 		 456 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714666  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  35.66 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0727  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 222 aa  70.5  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5326  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 221 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  34.13 
 
 		 282 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  37.3 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2880  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 220 aa  70.5  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  28.8 
 
 		 227 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  36.8 
 
 		 406 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  28.8 
 
 		 227 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>