More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_3033 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_3033  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 218 aa  430  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.190199 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3146  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.01 
 
 		 218 aa  249  3e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.149495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  46.3 
 
 		 221 aa  191  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.47 
 
 		 220 aa  188  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1039  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.47 
 
 		 222 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0917  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.91 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0603  DNA-binding response regulator  43.98 
 
 		 229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  44.91 
 
 		 223 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 220 aa  181  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.98 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  43.98 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0428  transcriptional regulator FeuP  43.72 
 
 		 221 aa  179  4e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.461578  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 		 220 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2735  two component transcriptional regulator  43.12 
 
 		 219 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  44.91 
 
 		 222 aa  178  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29730  putative two-component response regulator  47.49 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2674  two component transcriptional regulator  43.52 
 
 		 230 aa  178  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238816  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3144  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 		 226 aa  177  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.549897  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0604  DNA-binding response regulator  43.52 
 
 		 229 aa  177  8e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3772  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 222 aa  177  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  45.79 
 
 		 224 aa  177  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3217  two component transcriptional regulator  44.91 
 
 		 221 aa  177  9e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164246  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1287  two component transcriptional regulator  44.91 
 
 		 221 aa  177  9e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00449543  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  44.86 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2505  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.457878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  43.98 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3815  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.681737  normal  0.25062 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3088  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  47.69 
 
 		 219 aa  174  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1187  two component transcriptional regulatory protein  45.79 
 
 		 223 aa  174  8e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3353  response regulator receiver domain-containing protein  42.73 
 
 		 225 aa  174  9e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371413  normal  0.100473 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1433  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2543  putative two-component response regulator  47.03 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0177943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2695  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000581772  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.46 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.46 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  43.46 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  43.93 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3617  DNA-binding transcriptional regulator BasR  44.44 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000270917  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1997  winged helix family two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 224 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.59 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.59 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.59 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1264  response regulator receiver  42.79 
 
 		 243 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227049  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1354  two comoponent transcriptional regulator  46.54 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.12417  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7369  two component transcriptional regulator  44.91 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175011  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  46.76 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1947  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 222 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.421076  normal  0.0119241 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0229  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 227 aa  171  6.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.069189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2065  two component transcriptional regulator  43.98 
 
 		 221 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0454664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2347  winged helix family two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 222 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.26 
 
 		 218 aa  171  9e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3349  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 222 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.66 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2976  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.66 
 
 		 228 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.66 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3454  two component transcriptional regulator  44.86 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1244  DNA-binding response regulator  40.74 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000551267  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1995  two component transcriptional regulator  45.66 
 
 		 222 aa  169  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4647  DNA-binding response regulator  42.34 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3381  DNA-binding response regulator  47.06 
 
 		 222 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.060909  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1407  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1034  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.66 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.171933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003784  two-component system response regulator QseB  40.74 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  43.93 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1979  putative transcriptional regulator  40.28 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1787  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132601  normal  0.0795693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  43.98 
 
 		 227 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0447  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 229 aa  168  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000245325  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 222 aa  168  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3187  two component transcriptional regulator  46.3 
 
 		 229 aa  168  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0434  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.86 
 
 		 236 aa  168  7e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.569156 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3212  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.15 
 
 		 222 aa  168  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 224 aa  168  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 225 aa  167  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2596  two component transcriptional regulator  43.52 
 
 		 233 aa  167  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.606495  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4829  DNA-binding response regulator  44.86 
 
 		 235 aa  167  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00101292  normal  0.0130353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 799 aa  167  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 220 aa  167  9e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02658  hypothetical protein  40.28 
 
 		 219 aa  167  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3399  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 223 aa  167  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1913  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.25 
 
 		 221 aa  167  9e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1842  response regulator receiver protein  42.73 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  43.98 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>