More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0682 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0682  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
243 aa  488  1e-137  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1020  DNA-binding response regulator  42.98 
 
 
229 aa  211  9e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028316  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1192  DNA-binding response regulator  42.98 
 
 
229 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00982401  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2295  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.33 
 
 
237 aa  192  4e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0358  two component transcriptional regulator  41.35 
 
 
229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 
226 aa  174  9e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  39.66 
 
 
230 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  39.24 
 
 
230 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  39.24 
 
 
230 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  39.24 
 
 
230 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  39.24 
 
 
230 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  39.24 
 
 
230 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  39.24 
 
 
230 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  38.56 
 
 
230 aa  164  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  38.82 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1157  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.3 
 
 
233 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  38.82 
 
 
230 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0119  DNA-binding response regulator  38.91 
 
 
230 aa  162  6e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  36.71 
 
 
231 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  36.71 
 
 
231 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  36.71 
 
 
231 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  36.71 
 
 
231 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  36.29 
 
 
231 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  35.86 
 
 
231 aa  158  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.13 
 
 
236 aa  158  8e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  35.44 
 
 
231 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  36.55 
 
 
232 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  37.02 
 
 
227 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  36.97 
 
 
232 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3949  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.85 
 
 
219 aa  155  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  36.97 
 
 
232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  36.97 
 
 
232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  36.97 
 
 
232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.4 
 
 
224 aa  155  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  37.97 
 
 
230 aa  154  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  36.71 
 
 
231 aa  154  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  36.97 
 
 
232 aa  153  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  36.97 
 
 
232 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  36.97 
 
 
232 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 
232 aa  153  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  36.71 
 
 
231 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  37.97 
 
 
224 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0117  two component transcriptional regulator  34.73 
 
 
229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111014  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1735  DNA-binding response regulator  34.6 
 
 
228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0448  DNA-binding response regulator  34.17 
 
 
234 aa  152  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.223302  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  40.51 
 
 
248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.57 
 
 
237 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  38.24 
 
 
228 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.82 
 
 
234 aa  151  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4496  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.14 
 
 
245 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1493  two component transcriptional regulator  36.93 
 
 
232 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.340507 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  35.86 
 
 
232 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  33.47 
 
 
232 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0815  two component transcriptional regulator  37.14 
 
 
248 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.348891 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  35.86 
 
 
232 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.51 
 
 
234 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.45 
 
 
222 aa  149  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  34.18 
 
 
233 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  34.45 
 
 
230 aa  149  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2149  two component transcriptional regulator  38.3 
 
 
221 aa  148  6e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  34.03 
 
 
230 aa  148  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0459  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 
234 aa  148  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.025631  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5550  two component transcriptional regulator  37.96 
 
 
239 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5785  two component transcriptional regulator  37.96 
 
 
239 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  34.45 
 
 
233 aa  148  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  34.45 
 
 
233 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  34.45 
 
 
233 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  34.03 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  34.03 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.4 
 
 
227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  34.03 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  34.45 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  38.3 
 
 
254 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  36.4 
 
 
229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6809  two component transcriptional regulator  37.96 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2619  two component transcriptional regulator  37.08 
 
 
240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.67 
 
 
237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  38.3 
 
 
254 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1561  two component transcriptional regulator  37.96 
 
 
239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  34.45 
 
 
233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6268  two component transcriptional regulator  37.96 
 
 
239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.482642 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  34.45 
 
 
233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.61 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.318653  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6757  two component transcriptional regulator  37.96 
 
 
239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.250889  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5358  two component transcriptional regulator  37.14 
 
 
272 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  36.93 
 
 
231 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  36.29 
 
 
229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.74 
 
 
237 aa  146  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0351  DNA-binding response regulator  35.59 
 
 
230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  35.02 
 
 
225 aa  145  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  37.97 
 
 
321 aa  145  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0867  two component transcriptional regulator  36.25 
 
 
236 aa  145  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  35.02 
 
 
246 aa  145  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  36.13 
 
 
229 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  31.54 
 
 
228 aa  144  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.42 
 
 
226 aa  144  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3518  two component transcriptional regulator  32.64 
 
 
234 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.02 
 
 
261 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.24 
 
 
239 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 
231 aa  143  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>