More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2709 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2709  response regulator receiver protein  100 
 
 		 135 aa  270  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.755164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1967  response regulator receiver protein  81.95 
 
 		 141 aa  221  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0246648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0150  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 141 aa  120  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  0.0737587 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0965  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 128 aa  83.6  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00737627  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1495  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  38.14 
 
 		 458 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.301103  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1397  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 458 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 1045 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  37.4 
 
 		 230 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.15 
 
 		 508 aa  76.6  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.15 
 
 		 513 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2678  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 457 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0821  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.19 
 
 		 1139 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.187038 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 759 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 758 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2355  two component Fis family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 465 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.658958  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2944  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.14 
 
 		 223 aa  73.9  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  0.70587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1320  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  37.96 
 
 		 460 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 896 aa  73.2  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1635  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.19 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  34.75 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4041  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2928  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 447 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0337  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  33.9 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3523  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 991 aa  72  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2938  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 447 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1340  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 446 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.598769 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3070  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 447 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1435  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.89 
 
 		 447 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2591  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 		 457 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313706  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3669  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  34.38 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1798  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 450 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.77 
 
 		 225 aa  70.5  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.75 
 
 		 224 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.75 
 
 		 224 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0085  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 452 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  28.23 
 
 		 632 aa  69.7  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2880  two component transcriptional regulator  34.78 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3696  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.75 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2139  response regulator receiver  32 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.05 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3065  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.735156  hitchhiker  0.0000890784 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3230  flagellar regulatory protein C  36.89 
 
 		 446 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.05 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  34.19 
 
 		 391 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0528  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.2 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0317  two component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1322  sigma-54 factor, interaction region  35.83 
 
 		 446 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  33.9 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1280  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 446 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1347  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 446 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1364  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 485 aa  69.3  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0242  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.58 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 685 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0993  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.250481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3932  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 451 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0846  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282438 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0904  two component Fis family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 454 aa  67.8  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.81 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  33.9 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3076  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.95 
 
 		 454 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  36.36 
 
 		 785 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2524  DNA-binding response regulator  37.07 
 
 		 240 aa  67.8  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185339  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  36.36 
 
 		 785 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3092  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4371  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.14 
 
 		 451 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109269  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.5 
 
 		 223 aa  67.4  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1719  flagellar regulatory protein C  33.6 
 
 		 479 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0473988  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1534  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 463 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  28.23 
 
 		 229 aa  67  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 225 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2786  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.43 
 
 		 480 aa  67  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543097  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3647  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 451 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1655  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 462 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000025661  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1359  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 450 aa  67  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.594792  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  34.68 
 
 		 228 aa  67  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2578  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 446 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  36.36 
 
 		 785 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  30.47 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1322  two component transcriptional regulator  37.96 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3814  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.466742  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1220  response regulator receiver domain-containing protein  30.3 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  29.17 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 1433 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1603  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 449 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1496  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 451 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190196  normal  0.699272 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  36.36 
 
 		 785 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3227  response regulator receiver protein  33.65 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.30627  normal  0.696337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1003  nitrogen regulation protein NR(I)  36.54 
 
 		 481 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.158383  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2334  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2674  two component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238816  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 1118 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 406 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03164  hypothetical protein  33.6 
 
 		 469 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2217  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.51 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>