More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4356 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4356  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  100 
 
 
248 aa  482  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.509549  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4333  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  99.19 
 
 
248 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4201  response regulator receiver domain-containing protein  97.58 
 
 
262 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4350  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  66.94 
 
 
248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.767241  normal  0.344464 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3745  response regulator receiver domain-containing protein  49.17 
 
 
280 aa  214  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3886  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  48.97 
 
 
279 aa  214  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.267339  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3802  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  48.97 
 
 
279 aa  214  9e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0707641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6446  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  35.77 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6781  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  30.54 
 
 
264 aa  112  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2212  chemotaxis protein CheY  41.27 
 
 
128 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3862  response regulator receiver protein  50 
 
 
180 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.973714 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2302  response regulator receiver domain-containing protein  37.88 
 
 
127 aa  89.7  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0750  response regulator receiver protein  35.94 
 
 
125 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0765  response regulator receiver protein  35.94 
 
 
125 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.626658 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 
1143 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3136  response regulator receiver protein  35.94 
 
 
125 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.01 
 
 
1691 aa  83.2  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1267  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.11 
 
 
916 aa  82  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.17 
 
 
1216 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1158 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1924  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  36.51 
 
 
367 aa  78.6  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.620973  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  33.97 
 
 
1384 aa  78.6  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  34.38 
 
 
1060 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.98 
 
 
1788 aa  77.8  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 
1155 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 
1155 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5390  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 
1195 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596605  hitchhiker  0.00757911 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1163 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 
1155 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2108  multisensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
492 aa  77  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 
1149 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
1159 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.5 
 
 
1152 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.55 
 
 
1792 aa  75.9  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 
1356 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 
1142 aa  75.9  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3737  response regulator receiver protein  32.77 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00249462  normal  0.888945 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  42 
 
 
1165 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 
1161 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 
1651 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  34.67 
 
 
1170 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  35.33 
 
 
1172 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
1194 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.19 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  40 
 
 
928 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 
1137 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  33.86 
 
 
1327 aa  73.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  33.6 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  37.98 
 
 
1373 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.19 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  37.25 
 
 
1137 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.27 
 
 
1145 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 
1141 aa  73.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  31.3 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 
1189 aa  73.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426502  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0117  two component transcriptional regulator  34.4 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111014  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 
1168 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  39.52 
 
 
1299 aa  73.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1546  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.81 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.61009  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  40.91 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  36.04 
 
 
1200 aa  73.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 
1361 aa  73.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.3 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
1361 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3616  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
393 aa  72.8  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159723  normal  0.789101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.54 
 
 
1177 aa  72.8  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 
1248 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  32.8 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2029  response regulator receiver protein  39.84 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.371136 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  32.8 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 
1896 aa  72.4  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3814  response regulator receiver protein  32.03 
 
 
735 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.706947  hitchhiker  0.0056347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  36.72 
 
 
457 aa  72.4  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  38.76 
 
 
919 aa  72  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1815  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 
411 aa  72  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.800608  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0442  response regulator receiver protein  36.29 
 
 
126 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0489543  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  36.72 
 
 
457 aa  72  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2297  putative PAS/PAC sensor protein  35.48 
 
 
484 aa  72  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0617558  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 
1816 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  36.72 
 
 
421 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 
1287 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1411  FOG: CheY-like receiver  37.01 
 
 
131 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.19514e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3746  response regulator receiver protein  31.75 
 
 
714 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3688  response regulator receiver domain-containing protein  31.75 
 
 
718 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3829  response regulator receiver protein  31.75 
 
 
713 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0106552  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.65 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1215  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.07 
 
 
944 aa  71.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.960151  normal  0.101285 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.88 
 
 
738 aa  70.5  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 
1284 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0283  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
531 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 
1559 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3975  response regulator receiver domain-containing protein  39.84 
 
 
123 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44357  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
1048 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4086  response regulator receiver protein  39.06 
 
 
123 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0365078  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 
1002 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
1010 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4952  response regulator receiver protein  34.35 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 
1274 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  35.16 
 
 
457 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  43.44 
 
 
2070 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.607614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>