More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3737 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3737  response regulator receiver protein  100 
 
 		 281 aa  554  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00249462  normal  0.888945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6446  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  33.88 
 
 		 265 aa  122  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4356  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  30.71 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.509549  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4333  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  30.71 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4201  response regulator receiver domain-containing protein  29.96 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3802  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  32.24 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0707641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3745  response regulator receiver domain-containing protein  33.06 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3886  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  32.24 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.267339  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4350  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  27.82 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.767241  normal  0.344464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6781  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  40.5 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0960  histidine kinase  35.34 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  35.9 
 
 		 1020 aa  65.5  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1815  response regulator receiver domain-containing protein  35.21 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.800608  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  29.23 
 
 		 460 aa  63.2  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2754  two-component system response regulator  37.5 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.864218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0931  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.81 
 
 		 457 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.104843 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0967  diguanylate cyclase  34.81 
 
 		 457 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0207283 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  34.65 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  32.35 
 
 		 548 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  30.37 
 
 		 705 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.78 
 
 		 469 aa  60.8  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0907  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401363  normal  0.40647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  32.52 
 
 		 969 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 		 1559 aa  59.3  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1128  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  34.45 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.40399  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1580  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.128837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1655  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.014875  hitchhiker  0.000274191 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3577  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0722  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  35.35 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.84817e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  28.95 
 
 		 123 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1946  transcriptional regulatory protein PhoP  33.88 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  32.56 
 
 		 121 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4253  two component transcriptional regulator  36.22 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  30.16 
 
 		 556 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0710  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  34.34 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  30.25 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1724  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.235921 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3546  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal  0.686762 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0843  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000594696  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3138  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 647 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3862  response regulator receiver protein  39.37 
 
 		 180 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.973714 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3949  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.2 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1566  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.75 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435599 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3690  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 		 833 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.782884 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.9 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2695  response regulator receiver domain-containing protein  31.75 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00269866  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  32.48 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  32.23 
 
 		 123 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2065  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.56 
 
 		 615 aa  56.6  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.722895  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3831  response regulator receiver protein  33.7 
 
 		 554 aa  57  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839475  normal  0.508219 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  34.48 
 
 		 971 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6679  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.59 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1885  two component transcriptional regulator  30.71 
 
 		 219 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  35.71 
 
 		 1053 aa  56.2  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.96 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1827  two component transcriptional regulator  30.71 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00738443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2150  two component transcriptional regulator  30.71 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00200664  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 1048 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7417  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.59 
 
 		 457 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0467  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 802 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2014  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193015 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.98 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14310  Response regulator  33.61 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.98 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  29.75 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0381  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.77 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0578  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0130  two component transcriptional regulator  35.87 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.848842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3523  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.09 
 
 		 363 aa  55.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2614  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 227 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2255  two component transcriptional regulator  33.06 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.39138  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2501  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 227 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  32.2 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2494  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 227 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.178511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1334  two component transcriptional regulator  31.97 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2151  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  33.33 
 
 		 229 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.36 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0723779 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.13 
 
 		 385 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  31.34 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  28.8 
 
 		 685 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3134  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 500 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.952243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  28.76 
 
 		 652 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  29.6 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0506  adenylate/guanylate cyclase  31.25 
 
 		 380 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.149903  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2104  DNA-binding response regulator YgiX, putative  29.13 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1290  DNA-binding response regulator  29.91 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.36 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0368  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 695 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0590374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.75 
 
 		 523 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 230 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 		 602 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0062  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 		 807 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3871  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 227 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473157  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  31.36 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  32.77 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1850  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.88 
 
 		 224 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0826767  hitchhiker  0.000859255 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2240  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573737  hitchhiker  0.00000360672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>