More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3831 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3831  response regulator receiver protein  100 
 
 		 554 aa  1133    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839475  normal  0.508219 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  28.03 
 
 		 297 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  29.3 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  29.83 
 
 		 297 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  29.36 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  28.17 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  28.25 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  25.36 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  24.7 
 
 		 284 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  28.38 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  28.37 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  30.29 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  27.2 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  22.35 
 
 		 313 aa  63.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0435  response regulator receiver protein  36 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  26.57 
 
 		 496 aa  62  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  25.89 
 
 		 280 aa  62  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  25.35 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  25.55 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0693  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 639 aa  61.6  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000123693 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  24.06 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  23.55 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0681  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 639 aa  60.8  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.657626  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  26.92 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1958  DNA-binding transcriptional activator DcuR  32.74 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  26.48 
 
 		 291 aa  59.7  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  23.65 
 
 		 351 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  23.48 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  22.01 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  25.56 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2832  response regulator receiver protein  33.7 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.220444  hitchhiker  0.00935314 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  31.49 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  32.11 
 
 		 122 aa  57.8  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  38.67 
 
 		 121 aa  57.4  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  24.31 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  28.78 
 
 		 544 aa  57.4  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6143  putative two-component response regulator  36.84 
 
 		 300 aa  57  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3046  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.71 
 
 		 365 aa  57  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0429754  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  27.22 
 
 		 298 aa  57  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3737  response regulator receiver protein  33.7 
 
 		 281 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00249462  normal  0.888945 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 407 aa  56.6  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1263  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 129 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70790  putative two-component response regulator  36 
 
 		 300 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.864147 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  29.32 
 
 		 340 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.44 
 
 		 900 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5482  response regulator  35.9 
 
 		 297 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.420057  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  28.25 
 
 		 718 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3702  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.05 
 
 		 863 aa  55.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170309 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  26.74 
 
 		 124 aa  56.2  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2305  response regulator receiver and unknown domain protein  41.56 
 
 		 230 aa  56.2  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0391405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  23.21 
 
 		 282 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  27.66 
 
 		 351 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  28.42 
 
 		 297 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1834  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 		 681 aa  55.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5036  response regulator receiver  36.36 
 
 		 294 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.118598 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0841  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.17 
 
 		 223 aa  54.7  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  25.77 
 
 		 275 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  24.71 
 
 		 412 aa  54.7  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1590  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 485 aa  54.3  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0243  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 485 aa  53.9  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  30.59 
 
 		 355 aa  54.3  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2837  response regulator receiver protein  33.78 
 
 		 122 aa  54.3  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000598352 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0962  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.48 
 
 		 377 aa  54.3  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115091  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  29.76 
 
 		 302 aa  53.9  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3375  two-component response regulator CbrB  26.85 
 
 		 472 aa  53.9  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0307811  normal  0.146362 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0458  response regulator receiver  40.23 
 
 		 151 aa  53.9  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1874  two component signal response regulator LuxO  30.6 
 
 		 469 aa  53.9  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0317984  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 130 aa  53.9  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  28.33 
 
 		 280 aa  53.9  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  23.32 
 
 		 286 aa  53.9  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4008  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 456 aa  53.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  27.42 
 
 		 279 aa  53.5  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0064  response regulator receiver and unknown domain protein  47.69 
 
 		 238 aa  53.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.803731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2242  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.61 
 
 		 464 aa  53.5  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.719582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  26.37 
 
 		 2325 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5319  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 137 aa  53.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0886883  normal  0.780288 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0337  response regulator receiver protein  34.57 
 
 		 126 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081011  hitchhiker  0.000378914 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2392  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.73 
 
 		 458 aa  53.5  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0321511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  31 
 
 		 236 aa  53.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1044  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.48 
 
 		 377 aa  53.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0516082 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  30.28 
 
 		 302 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1352  response regulator receiver protein  30.39 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  24.51 
 
 		 455 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2511  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.29 
 
 		 244 aa  52.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0879  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 489 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  34.83 
 
 		 981 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  34.25 
 
 		 130 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  32.29 
 
 		 280 aa  52.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  35.21 
 
 		 128 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  31.48 
 
 		 971 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  34.25 
 
 		 130 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 394 aa  52.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1537  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 311 aa  52.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.376192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  32.61 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  28.89 
 
 		 269 aa  52  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 509 aa  52  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 		 1616 aa  51.6  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  26.06 
 
 		 415 aa  52  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0258  osmolarity response regulator  32.63 
 
 		 246 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 		 1155 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>