More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2832 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2832  response regulator receiver protein  100 
 
 		 248 aa  499  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.220444  hitchhiker  0.00935314 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2837  response regulator receiver protein  47.54 
 
 		 122 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000598352 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  34.78 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0150  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5324  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0104194 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5232  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.240509 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  32.74 
 
 		 803 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0283  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  34.19 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5371  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  32.48 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  33.85 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  31.93 
 
 		 769 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 1155 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  31.93 
 
 		 769 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6194  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.66 
 
 		 222 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  33.05 
 
 		 124 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  31.93 
 
 		 769 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2712  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 131 aa  67.8  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 1616 aa  67  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  33.61 
 
 		 129 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 127 aa  67.4  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 128 aa  67.4  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 129 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 129 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  34.43 
 
 		 768 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 129 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  33.61 
 
 		 129 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  33.61 
 
 		 129 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 131 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  29.91 
 
 		 774 aa  66.6  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 131 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2834  response regulator receiver protein  30.6 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138077  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3021  sporulation transcriptional activator Spo0A  35.77 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000341276  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  34.62 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1392  sporulation transcriptional activator Spo0A  29.68 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.664762  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  34.19 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  35.59 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  34.62 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0990  CheA signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 1085 aa  66.6  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4023  sporulation transcriptional activator Spo0A  29.23 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0869765  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1426  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  34.75 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  30 
 
 		 785 aa  66.2  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  35.59 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  33.08 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1815  response regulator receiver domain-containing protein  35.51 
 
 		 411 aa  65.9  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.800608  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  33.08 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  33.08 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  33.08 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.15 
 
 		 472 aa  65.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  33.08 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  33.08 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 977 aa  65.9  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  33.08 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0749  response regulator receiver protein  28.83 
 
 		 406 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.893418  normal  0.0890519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.1 
 
 		 2325 aa  65.5  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 372 aa  65.5  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0241  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  36.44 
 
 		 124 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  31.09 
 
 		 131 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0904  two component Fis family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  32.17 
 
 		 131 aa  65.1  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0692  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.47 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.370043  unclonable  0.00000000838432 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2152  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.03 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0525986 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  33.91 
 
 		 132 aa  64.7  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 129 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 127 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  28.79 
 
 		 130 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  34.75 
 
 		 127 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 123 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0693  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 639 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000123693 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 127 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6059  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30 
 
 		 458 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0839917 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  27.73 
 
 		 770 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 127 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2431  response regulator receiver domain-containing protein  34.11 
 
 		 131 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000210514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 127 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  31.36 
 
 		 129 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 126 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2837  response regulator receiver domain-containing protein  31.71 
 
 		 129 aa  64.3  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  34.75 
 
 		 130 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  37.29 
 
 		 128 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  28.79 
 
 		 130 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 127 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 127 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 127 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  28.79 
 
 		 130 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 127 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1787  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 141 aa  63.9  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.860265  normal  0.648843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>