More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0337 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0337  response regulator receiver protein  100 
 
 		 126 aa  256  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081011  hitchhiker  0.000378914 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1791  response regulator receiver protein  44.55 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3787  response regulator receiver protein  40.8 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3884  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110956  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1220  CheY-like response regulator  47.54 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0243191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3821  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3744  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.139387  hitchhiker  0.00363561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3567  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  37.9 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3740  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  41.86 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3361  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  33.59 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.9 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  35.66 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  35.25 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0148  response regulator, CheY-like  35.25 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4725  response regulator receiver protein  36.15 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  38.58 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 292 aa  72  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1464  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000820366  normal  0.014977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  46.75 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3819  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 154 aa  70.1  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.752966  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  30.95 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5581  response regulator receiver protein  34.4 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3767  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  33.6 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3763  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113093  normal  0.0284745 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2082  two-component response regulator, cheY-like  41.18 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.988257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  32.28 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  33.86 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  35.94 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  32.5 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  30.4 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 165 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 157 aa  67  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 153 aa  67  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  32.81 
 
 		 148 aa  67  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  47.89 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  45.83 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  35.77 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  33.02 
 
 		 355 aa  65.5  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  28.93 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  32.8 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0824  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.494027  normal  0.693271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2652  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 242 aa  64.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3986  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  40.54 
 
 		 236 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.694656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0104  response regulator, putative  31.71 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  33.87 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1269  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.019586  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  29.06 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 1127 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  29.75 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0384  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0372  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 755 aa  62.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  31.97 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 		 1271 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  32 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3183  response regulator receiver protein  45.21 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03243  chemotaxis protein CheY  32.89 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3822  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0383482  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0314  histidine kinase  39.19 
 
 		 531 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>