More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4725 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4725  response regulator receiver protein  100 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2351  response regulator receiver protein  35.42 
 
 		 157 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  38.81 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  38.81 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4440  response regulator receiver protein  37.78 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 151 aa  87.4  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  33.8 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 149 aa  84.3  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  36.96 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  34.56 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  34.75 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  34.35 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 163 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  36.03 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  33.57 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  32.86 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  36.03 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  32.17 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  33.82 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  35.04 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  36.03 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  38.35 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  34.81 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  33.1 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  32.35 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  30.37 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1229  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3426  response regulator receiver protein  34.04 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0768314  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  36.43 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  35.97 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0749  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  34.07 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  30.15 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0168  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  30.37 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  31.39 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  35.61 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  36.03 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  32.31 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0384  response regulator receiver protein  34.81 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  37.4 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  34.62 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  36.03 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4516  response regulator receiver protein  37.31 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 148 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  32.33 
 
 		 162 aa  72  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  27.21 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4150  response regulator receiver protein  30.66 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  32.59 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  32.59 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  37.8 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  43.82 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  34.03 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4374  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00391963  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  34.09 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  32.81 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  35.61 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  32.59 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  32.33 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  32.58 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0104  response regulator, putative  39.17 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  34.06 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  38.82 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  31.85 
 
 		 149 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  31.11 
 
 		 146 aa  70.1  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  34.81 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5222  response regulator receiver protein  28.47 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2912  response regulator receiver protein  36.15 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  30.15 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  38.35 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  34.33 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  31.34 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  31.39 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  37.14 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0286  response regulator receiver protein  35 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  34.33 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  28.68 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0337  response regulator receiver protein  36.7 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081011  hitchhiker  0.000378914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>