More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4374 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4374  response regulator receiver protein  100 
 
 		 155 aa  320  5e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00391963  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0153  response regulator receiver protein  46.76 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.364118  hitchhiker  0.0000231464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4150  response regulator receiver protein  43.38 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5222  response regulator receiver protein  39.71 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1229  response regulator receiver protein  40.88 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4149  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5581  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 289 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2604  response regulator receiver and unknown domain protein  33.33 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0557258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 292 aa  87  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0796  response regulator receiver protein  33.82 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.292352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  31.16 
 
 		 299 aa  80.5  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  33.74 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  32.87 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  30.28 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  30.22 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  30.22 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  28.97 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4440  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  29.5 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  30.61 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  32.21 
 
 		 148 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  30.67 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  32.37 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  30.22 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  29.94 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1286  response regulator receiver protein  32.37 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  31.34 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  30 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4725  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  31.01 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  30.52 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  38.82 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  32.41 
 
 		 152 aa  70.1  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  31.21 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5086  response regulator receiver protein  30.37 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00855008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  29.29 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2351  response regulator receiver protein  33.78 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  30.88 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  29.86 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  29.5 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  28.87 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  33.57 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  30.3 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  29.45 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  28.26 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  40.51 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  28.19 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  33.94 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  30.6 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  40 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  29.01 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  28.36 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  30.22 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  28.79 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  27.91 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  32.59 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0749  response regulator receiver protein  29.93 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  29.8 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  29.32 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  29.79 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  28.24 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  29.32 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  27.54 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  31.54 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  37.65 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  32.93 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  32.37 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  36.59 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  26.52 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5266  response regulator receiver protein  26.95 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.481643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  26.32 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  29.71 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  25.76 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  29.14 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  38.64 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  29.14 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  29.14 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  25.76 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  30.83 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0168  response regulator receiver protein  39.74 
 
 		 179 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  25.76 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  27.81 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>