More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4150 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4150  response regulator receiver protein  100 
 
 		 160 aa  327  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5222  response regulator receiver protein  63.12 
 
 		 160 aa  222  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1229  response regulator receiver protein  47.1 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4374  response regulator receiver protein  43.38 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00391963  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  36.49 
 
 		 292 aa  99  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4149  response regulator receiver protein  38.41 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2604  response regulator receiver and unknown domain protein  37.67 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0557258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0153  response regulator receiver protein  36.55 
 
 		 160 aa  87.4  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.364118  hitchhiker  0.0000231464 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  36.92 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1286  response regulator receiver protein  35.56 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0796  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.292352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  38.57 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5581  response regulator receiver protein  31.91 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  37.24 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  36.05 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  36.5 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  36.49 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  34.44 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  40.21 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  34.44 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  35.66 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  31.33 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  34.53 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  34.53 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  32.37 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  33.57 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  34.01 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  35 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  37.68 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  31.94 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  30 
 
 		 299 aa  74.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  36.55 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  34.56 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  42.53 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  38.73 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5086  response regulator receiver protein  33.1 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00855008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  31.21 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  40.38 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  43.68 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4725  response regulator receiver protein  30.66 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  36.96 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  33.57 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  34.35 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  42.53 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  36 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  42.53 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  40.23 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  33.1 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  34.27 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  28.86 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3763  response regulator receiver protein  31.91 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113093  normal  0.0284745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  31.65 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  32.33 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  30.5 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  36.54 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  39.08 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  31.94 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  41.86 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  28.87 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  31.16 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  27.52 
 
 		 162 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  35.42 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  34.04 
 
 		 148 aa  67  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  32.64 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  36.22 
 
 		 142 aa  67  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  32.65 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  31.16 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  33.57 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  28.36 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  30.23 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4440  response regulator receiver protein  32.12 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  30.07 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5264  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  31.21 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5266  response regulator receiver protein  25 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.481643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  32.43 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  33.33 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  33.1 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  33.98 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  31.72 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0170  DNA-binding response regulator  30.95 
 
 		 232 aa  63.9  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  31.51 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.91 
 
 		 230 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.91 
 
 		 230 aa  63.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  31.62 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>