More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1519 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  100 
 
 
181 aa  374  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  64.84 
 
 
139 aa  174  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  60 
 
 
139 aa  170  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  61.03 
 
 
150 aa  168  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  58.46 
 
 
146 aa  167  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  60 
 
 
154 aa  165  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  62.02 
 
 
145 aa  164  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  56.03 
 
 
154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  55.47 
 
 
165 aa  160  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  57.89 
 
 
143 aa  160  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  54.48 
 
 
148 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  55.73 
 
 
148 aa  159  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  56.59 
 
 
148 aa  158  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  57.46 
 
 
148 aa  157  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  58.09 
 
 
148 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  56.43 
 
 
150 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  56.43 
 
 
150 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  56.43 
 
 
150 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  56.43 
 
 
150 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  56.43 
 
 
150 aa  154  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  56.43 
 
 
150 aa  154  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  57.69 
 
 
145 aa  154  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  56.43 
 
 
150 aa  154  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  52.52 
 
 
148 aa  153  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  49.29 
 
 
147 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  49.29 
 
 
147 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  52.99 
 
 
145 aa  153  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  58.87 
 
 
146 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  55.97 
 
 
150 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  58.14 
 
 
149 aa  151  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  54.62 
 
 
146 aa  151  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  56.15 
 
 
144 aa  151  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  56.06 
 
 
145 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  55.3 
 
 
146 aa  149  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  53.85 
 
 
146 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  52.52 
 
 
148 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  54.62 
 
 
150 aa  148  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  52.59 
 
 
146 aa  148  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  53.08 
 
 
147 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  53.08 
 
 
147 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  53.08 
 
 
147 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  49.63 
 
 
147 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  52.31 
 
 
144 aa  144  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  52.63 
 
 
149 aa  144  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  51.47 
 
 
153 aa  143  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  52.67 
 
 
148 aa  141  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  53.68 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  50 
 
 
146 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  50.38 
 
 
148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  50.36 
 
 
144 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  50.38 
 
 
144 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  45.39 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0524  response regulator receiver protein  46.04 
 
 
155 aa  124  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  46.43 
 
 
151 aa  122  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  45.99 
 
 
150 aa  120  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  48.15 
 
 
149 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  45.11 
 
 
152 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  44.37 
 
 
162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1095  response regulator receiver protein  43.54 
 
 
171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  40.26 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  43.08 
 
 
153 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  45.45 
 
 
167 aa  115  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  43.66 
 
 
162 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  40.6 
 
 
146 aa  114  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  43.85 
 
 
153 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  38.97 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  42.65 
 
 
150 aa  112  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4530  response regulator receiver protein  45.86 
 
 
146 aa  112  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  43.51 
 
 
153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  46.28 
 
 
152 aa  111  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  41.96 
 
 
153 aa  111  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  46.27 
 
 
149 aa  111  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  44.7 
 
 
145 aa  110  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  41.3 
 
 
147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  40 
 
 
146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  44.19 
 
 
148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  42.65 
 
 
151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0458  response regulator receiver  39.26 
 
 
151 aa  107  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  37.67 
 
 
147 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  40.91 
 
 
156 aa  106  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  41.22 
 
 
160 aa  107  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4797  response regulator receiver protein  45.52 
 
 
150 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.474617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  44.7 
 
 
150 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  39.42 
 
 
148 aa  106  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  42.18 
 
 
153 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  39.74 
 
 
156 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3139  response regulator receiver protein  44.88 
 
 
138 aa  106  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  43.94 
 
 
148 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3985  response regulator receiver protein  38.78 
 
 
152 aa  105  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1954  response regulator receiver protein  43.18 
 
 
151 aa  105  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  48.46 
 
 
146 aa  104  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  40.15 
 
 
151 aa  103  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1247  response regulator receiver protein  50.43 
 
 
140 aa  103  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  40.15 
 
 
152 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  42.75 
 
 
155 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  39.31 
 
 
151 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  44.36 
 
 
152 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  42.22 
 
 
143 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  43.94 
 
 
151 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 
147 aa  101  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>