More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5035 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  100 
 
 		 145 aa  290  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  76.39 
 
 		 149 aa  221  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  76.26 
 
 		 145 aa  220  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  74.83 
 
 		 148 aa  219  7e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  78.1 
 
 		 143 aa  218  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  75 
 
 		 165 aa  218  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  76.15 
 
 		 146 aa  212  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  74.1 
 
 		 146 aa  210  7e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  76.09 
 
 		 144 aa  209  9e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  69.06 
 
 		 146 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  69.06 
 
 		 146 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  69.57 
 
 		 147 aa  196  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  69.57 
 
 		 147 aa  196  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  69.57 
 
 		 147 aa  196  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  66.67 
 
 		 146 aa  193  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  67.83 
 
 		 148 aa  189  8e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  63.77 
 
 		 150 aa  186  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  64.29 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  60.58 
 
 		 150 aa  183  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  63.77 
 
 		 149 aa  182  9e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  59.85 
 
 		 150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  59.85 
 
 		 150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  62.04 
 
 		 148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  59.85 
 
 		 150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  59.85 
 
 		 150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  59.85 
 
 		 150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  59.85 
 
 		 150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  59.85 
 
 		 150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  60.58 
 
 		 139 aa  179  9.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  62.04 
 
 		 139 aa  179  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  59.71 
 
 		 154 aa  177  5.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  57.64 
 
 		 146 aa  176  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  62.22 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  54.86 
 
 		 148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  57.66 
 
 		 147 aa  171  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  58.7 
 
 		 150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  54.86 
 
 		 146 aa  170  5e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  60.58 
 
 		 144 aa  170  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  55.47 
 
 		 148 aa  164  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  56.2 
 
 		 148 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  56.12 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  59.12 
 
 		 144 aa  160  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 153 aa  160  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  55.47 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  51.02 
 
 		 151 aa  151  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  54.07 
 
 		 148 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  52.59 
 
 		 148 aa  150  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  56.06 
 
 		 181 aa  150  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  50.35 
 
 		 151 aa  147  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  50 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  48.57 
 
 		 152 aa  147  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  52.59 
 
 		 148 aa  144  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  49.66 
 
 		 152 aa  141  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  51.82 
 
 		 162 aa  140  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  46.26 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  45.99 
 
 		 144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  51.82 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  48.89 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  46.04 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  48.51 
 
 		 149 aa  130  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0524  response regulator receiver protein  47.79 
 
 		 155 aa  130  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  47.83 
 
 		 147 aa  130  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  46.04 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1095  response regulator receiver protein  43.17 
 
 		 171 aa  127  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  46.76 
 
 		 150 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  47.95 
 
 		 153 aa  127  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  48.18 
 
 		 149 aa  126  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  47.45 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 146 aa  125  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  47.14 
 
 		 160 aa  125  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  46.38 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  44.93 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  47.1 
 
 		 146 aa  123  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  48.12 
 
 		 167 aa  123  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  48.84 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  45.26 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  45.99 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  45.26 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  45.99 
 
 		 153 aa  121  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  45.65 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  46.38 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  41.73 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  40.43 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  44.2 
 
 		 151 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  44.52 
 
 		 173 aa  118  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  42.96 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 155 aa  117  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  44.44 
 
 		 146 aa  117  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 164 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4440  response regulator receiver protein  43.26 
 
 		 145 aa  117  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4797  response regulator receiver protein  45.26 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.474617  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  40.15 
 
 		 146 aa  114  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  44.36 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>