More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2147 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  100 
 
 		 153 aa  306  9e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  63.77 
 
 		 148 aa  183  8e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  61.27 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  62.04 
 
 		 144 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  61.31 
 
 		 165 aa  169  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  51.03 
 
 		 148 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  56.12 
 
 		 150 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  56.12 
 
 		 150 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  56.12 
 
 		 150 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  56.12 
 
 		 150 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  58.39 
 
 		 149 aa  165  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  56.12 
 
 		 150 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  56.12 
 
 		 150 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  56.12 
 
 		 150 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  57.14 
 
 		 146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  51.8 
 
 		 148 aa  163  9e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  55.4 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  57.25 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  53.96 
 
 		 139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  55.63 
 
 		 145 aa  161  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  54.74 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 145 aa  160  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  54.68 
 
 		 150 aa  159  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  54.74 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  50 
 
 		 149 aa  157  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  55 
 
 		 147 aa  156  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  54.74 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  50.36 
 
 		 146 aa  155  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  45.83 
 
 		 146 aa  152  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  55.3 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  49.64 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  49.64 
 
 		 146 aa  150  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  50 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  50 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  50 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  49.26 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  52.17 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  51.8 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  48.55 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  51.47 
 
 		 181 aa  143  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  48.18 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  45.99 
 
 		 148 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  43.07 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  43.07 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  45.93 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  50.36 
 
 		 145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  48.97 
 
 		 150 aa  136  7.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  44.93 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  43.45 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  50.72 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  46 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  42.14 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  46.53 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  44.68 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  44.67 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  44.6 
 
 		 153 aa  121  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  45.71 
 
 		 144 aa  120  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  44 
 
 		 162 aa  120  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  45.32 
 
 		 149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  44.53 
 
 		 150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  44.53 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  44.2 
 
 		 151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  47.83 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  41.01 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  39.72 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  45.32 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  47.45 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  44.2 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1954  response regulator receiver protein  45.07 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  40.88 
 
 		 145 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  39.72 
 
 		 160 aa  113  8.999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1095  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 171 aa  112  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  39.29 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  44.6 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0524  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  42.45 
 
 		 153 aa  110  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  43.57 
 
 		 160 aa  110  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  44.22 
 
 		 149 aa  110  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  44.93 
 
 		 153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  44.93 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  44.93 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  38.89 
 
 		 143 aa  107  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  46.09 
 
 		 146 aa  107  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  44.2 
 
 		 153 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  44.2 
 
 		 153 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  40.6 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  41.48 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  42.36 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  41.84 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4797  response regulator receiver protein  39.33 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.474617  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  43.85 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  38.03 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  40.29 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>