More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_22950 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  100 
 
 
146 aa  286  5.0000000000000004e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  81.43 
 
 
145 aa  228  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  76.71 
 
 
165 aa  220  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  76.98 
 
 
143 aa  213  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  74.1 
 
 
145 aa  210  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  76.09 
 
 
149 aa  208  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  73.91 
 
 
148 aa  203  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  73.79 
 
 
144 aa  202  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  64.83 
 
 
146 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  73.48 
 
 
146 aa  197  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  64.14 
 
 
146 aa  192  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  63.45 
 
 
147 aa  191  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  63.45 
 
 
147 aa  191  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  66.91 
 
 
149 aa  191  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  63.45 
 
 
147 aa  191  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  63.01 
 
 
146 aa  186  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  63.04 
 
 
150 aa  182  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  67.39 
 
 
148 aa  181  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  61.54 
 
 
154 aa  181  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  63.12 
 
 
145 aa  181  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  63.5 
 
 
150 aa  180  7e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  63.5 
 
 
150 aa  180  7e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  63.5 
 
 
150 aa  180  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  63.5 
 
 
150 aa  180  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  63.5 
 
 
150 aa  180  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  63.5 
 
 
150 aa  180  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  63.5 
 
 
150 aa  180  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  63.5 
 
 
150 aa  180  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  59.72 
 
 
146 aa  178  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  60.71 
 
 
150 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  53.96 
 
 
146 aa  176  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  62.14 
 
 
154 aa  173  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  56.52 
 
 
139 aa  171  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  59.71 
 
 
139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  55.4 
 
 
148 aa  169  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  56.2 
 
 
148 aa  164  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  57.14 
 
 
153 aa  163  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  60.14 
 
 
144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  52.9 
 
 
148 aa  157  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  54.74 
 
 
147 aa  154  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  54.35 
 
 
145 aa  151  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  47.92 
 
 
148 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  51.09 
 
 
148 aa  149  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  55.3 
 
 
181 aa  149  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  49.31 
 
 
151 aa  148  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  49.64 
 
 
147 aa  146  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  49.64 
 
 
147 aa  146  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  52.78 
 
 
151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  51.8 
 
 
145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  49.63 
 
 
148 aa  145  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  55.8 
 
 
144 aa  145  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  48.15 
 
 
148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  48.94 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  48.59 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  48.57 
 
 
151 aa  138  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  41.67 
 
 
144 aa  138  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  45.39 
 
 
152 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  49.26 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1095  response regulator receiver protein  43.84 
 
 
171 aa  131  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  49.26 
 
 
155 aa  130  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  48.2 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  47.01 
 
 
149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0524  response regulator receiver protein  47.06 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  48.18 
 
 
162 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  47.1 
 
 
148 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  43.88 
 
 
160 aa  125  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  47.01 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1954  response regulator receiver protein  47.14 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  47.1 
 
 
146 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4797  response regulator receiver protein  44.29 
 
 
150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.474617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  46.46 
 
 
152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  47.45 
 
 
162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  48.46 
 
 
153 aa  124  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  40.97 
 
 
148 aa  123  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  39.04 
 
 
146 aa  123  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  46.38 
 
 
146 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  41.84 
 
 
156 aa  120  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4530  response regulator receiver protein  44.85 
 
 
146 aa  120  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  43.17 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  46.32 
 
 
149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  42.34 
 
 
146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  45.99 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0749  response regulator receiver protein  44.29 
 
 
156 aa  118  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  44.53 
 
 
156 aa  118  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  43.88 
 
 
147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  44.7 
 
 
149 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  42.75 
 
 
152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  45.38 
 
 
164 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  42.03 
 
 
145 aa  116  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  39.57 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  44.12 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  44.36 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  40.85 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  45.99 
 
 
151 aa  115  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  40.43 
 
 
148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3985  response regulator receiver protein  42.96 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  43.61 
 
 
153 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  41.61 
 
 
146 aa  114  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  43.17 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  41.3 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>