More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0684 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  100 
 
 		 148 aa  296  8e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  63.77 
 
 		 153 aa  183  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  57.25 
 
 		 143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  57.25 
 
 		 144 aa  167  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  52.52 
 
 		 148 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  56.2 
 
 		 146 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  53.15 
 
 		 149 aa  164  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  56.2 
 
 		 165 aa  164  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  55.4 
 
 		 154 aa  164  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  55.47 
 
 		 145 aa  164  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  53.57 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  51.45 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  51.05 
 
 		 145 aa  159  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  55.71 
 
 		 145 aa  157  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  52.9 
 
 		 139 aa  157  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  49.66 
 
 		 147 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  49.66 
 
 		 147 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  49.66 
 
 		 147 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  47.52 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  49.64 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  49.31 
 
 		 146 aa  153  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  51.45 
 
 		 150 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  51.45 
 
 		 150 aa  153  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  51.45 
 
 		 150 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  51.45 
 
 		 150 aa  153  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  51.45 
 
 		 150 aa  153  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  51.45 
 
 		 150 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  51.45 
 
 		 150 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  50.72 
 
 		 146 aa  152  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  52.52 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  50.72 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  49.31 
 
 		 146 aa  150  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  49.28 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  50 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  48.25 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  49.28 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  50 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  52.55 
 
 		 144 aa  144  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 147 aa  144  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  50.36 
 
 		 149 aa  144  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  50 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  47.45 
 
 		 139 aa  141  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  51.82 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  45.39 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  45.83 
 
 		 152 aa  137  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  46.32 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  45.39 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  45.39 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  50.38 
 
 		 181 aa  134  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  44.76 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  47.14 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  45.26 
 
 		 151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  45.99 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 148 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  44.52 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  44.6 
 
 		 162 aa  124  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  45 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  46.81 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  40.15 
 
 		 143 aa  121  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  44.6 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  43.06 
 
 		 153 aa  118  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1095  response regulator receiver protein  42.45 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  43.88 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  39.57 
 
 		 146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  44.76 
 
 		 149 aa  117  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  45.26 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  37.23 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  42.22 
 
 		 143 aa  114  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  43.17 
 
 		 153 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  42.14 
 
 		 148 aa  113  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4797  response regulator receiver protein  44.2 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.474617  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  43.17 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  43.17 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0524  response regulator receiver protein  42.96 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  41.89 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  42.14 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  42.03 
 
 		 160 aa  110  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  41.73 
 
 		 153 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  41.43 
 
 		 149 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  42.14 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  42.22 
 
 		 143 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  41.89 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  40.28 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  42.55 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4530  response regulator receiver protein  42.75 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  39.86 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 153 aa  107  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  42.75 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  39.58 
 
 		 146 aa  107  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 155 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  42.75 
 
 		 151 aa  105  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  43.38 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  39.01 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2095  response regulator receiver protein  43.44 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  38.62 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>