More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0753 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  100 
 
 
146 aa  302  9.000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  55 
 
 
151 aa  159  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  54.35 
 
 
151 aa  159  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  51.35 
 
 
150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  48.92 
 
 
149 aa  147  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  48.61 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  42.18 
 
 
160 aa  137  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  45.21 
 
 
165 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  46.1 
 
 
153 aa  134  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  45.21 
 
 
150 aa  130  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  46.94 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  44.53 
 
 
148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  42.45 
 
 
146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  49.32 
 
 
173 aa  128  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  41.43 
 
 
148 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  38.85 
 
 
148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  41.13 
 
 
145 aa  125  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  42.96 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  43.48 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  44.29 
 
 
151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  40.15 
 
 
154 aa  123  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  36.05 
 
 
154 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.04 
 
 
146 aa  123  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  40.14 
 
 
147 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  40.14 
 
 
147 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  39.42 
 
 
154 aa  121  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  37.41 
 
 
146 aa  120  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  40.29 
 
 
146 aa  120  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  36.62 
 
 
145 aa  120  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  38.85 
 
 
139 aa  120  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  38.13 
 
 
139 aa  120  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  40.29 
 
 
149 aa  120  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  38.85 
 
 
143 aa  120  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  39.57 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  41.3 
 
 
148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  39.44 
 
 
145 aa  118  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  39.57 
 
 
148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  40.91 
 
 
146 aa  117  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  34.93 
 
 
144 aa  117  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  36.05 
 
 
155 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  38.13 
 
 
147 aa  116  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  38.13 
 
 
147 aa  116  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  38.13 
 
 
147 aa  116  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  37.41 
 
 
146 aa  115  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  38.13 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  36.73 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  39.86 
 
 
148 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  39.46 
 
 
153 aa  114  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  39.29 
 
 
150 aa  114  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  38.97 
 
 
181 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  37.68 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  38.69 
 
 
150 aa  111  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  40.15 
 
 
148 aa  111  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  36.36 
 
 
153 aa  111  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  36.43 
 
 
149 aa  111  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  35.97 
 
 
144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3426  response regulator receiver protein  32.65 
 
 
154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0768314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  36.84 
 
 
162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  36.5 
 
 
148 aa  110  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  38.64 
 
 
145 aa  110  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  37.86 
 
 
150 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  37.86 
 
 
150 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  37.86 
 
 
150 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  37.86 
 
 
150 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  37.86 
 
 
150 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  37.86 
 
 
150 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  37.86 
 
 
150 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  39.42 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  38.85 
 
 
148 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  36.09 
 
 
162 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  38.85 
 
 
153 aa  107  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  36.57 
 
 
146 aa  107  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  36.09 
 
 
145 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  36.57 
 
 
147 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  40.46 
 
 
131 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  36.09 
 
 
150 aa  104  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  34.78 
 
 
151 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  36.84 
 
 
149 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 
144 aa  103  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  37.78 
 
 
149 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 
150 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  37.12 
 
 
149 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  36.69 
 
 
151 aa  101  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  31.16 
 
 
149 aa  101  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  36.3 
 
 
153 aa  101  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  36.09 
 
 
152 aa  101  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  33.83 
 
 
153 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  38.69 
 
 
148 aa  101  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  34.59 
 
 
146 aa  101  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  36.5 
 
 
150 aa  100  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  32.12 
 
 
147 aa  100  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  33.57 
 
 
148 aa  100  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  34.78 
 
 
145 aa  100  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  35.97 
 
 
150 aa  100  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  39.26 
 
 
149 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  35.77 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  36.15 
 
 
160 aa  99  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  31.25 
 
 
151 aa  98.6  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  38.97 
 
 
150 aa  98.2  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  35.34 
 
 
147 aa  97.8  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>