More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1704 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  100 
 
 
139 aa  285  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  61.59 
 
 
143 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  64.03 
 
 
146 aa  186  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  64.23 
 
 
139 aa  186  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  60.14 
 
 
154 aa  185  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  62.04 
 
 
150 aa  184  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  61.59 
 
 
165 aa  184  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  59.42 
 
 
154 aa  181  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  60.87 
 
 
149 aa  180  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  60.58 
 
 
145 aa  179  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  59.85 
 
 
144 aa  179  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  59.85 
 
 
148 aa  176  9e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  61.15 
 
 
148 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  60.58 
 
 
148 aa  174  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  58.39 
 
 
148 aa  174  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  59.12 
 
 
145 aa  173  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  55.07 
 
 
145 aa  172  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  56.52 
 
 
146 aa  171  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  57.66 
 
 
150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  56.83 
 
 
148 aa  170  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  60 
 
 
181 aa  170  6.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  59.12 
 
 
148 aa  168  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  58.39 
 
 
150 aa  166  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  57.66 
 
 
150 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  57.66 
 
 
150 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  57.66 
 
 
150 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  57.66 
 
 
150 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  57.66 
 
 
150 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  52.55 
 
 
147 aa  165  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  54.74 
 
 
146 aa  165  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  58.27 
 
 
145 aa  165  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  57.66 
 
 
150 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  57.66 
 
 
150 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  55.3 
 
 
146 aa  164  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  52.55 
 
 
147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  52.55 
 
 
147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  54.74 
 
 
146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  55.47 
 
 
146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  51.82 
 
 
149 aa  159  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  52.52 
 
 
148 aa  158  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  53.28 
 
 
147 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  53.28 
 
 
147 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  53.28 
 
 
147 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  54.01 
 
 
148 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  51.82 
 
 
144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  52.55 
 
 
146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  52.21 
 
 
145 aa  149  8.999999999999999e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  51.8 
 
 
151 aa  148  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  48.18 
 
 
153 aa  142  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  45.99 
 
 
151 aa  142  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  47.45 
 
 
148 aa  141  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  46.43 
 
 
150 aa  140  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  50.37 
 
 
144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1095  response regulator receiver protein  46.76 
 
 
171 aa  137  6e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  49.62 
 
 
153 aa  136  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  48.18 
 
 
150 aa  135  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  47.83 
 
 
146 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4797  response regulator receiver protein  49.64 
 
 
150 aa  132  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.474617  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0524  response regulator receiver protein  47.01 
 
 
155 aa  131  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  43.48 
 
 
152 aa  131  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  45.77 
 
 
151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  47.83 
 
 
146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  45.65 
 
 
160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  51.82 
 
 
173 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3985  response regulator receiver protein  47.73 
 
 
152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1954  response regulator receiver protein  45.32 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  43.07 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4530  response regulator receiver protein  44.85 
 
 
146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  46.97 
 
 
145 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  42.75 
 
 
149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  50 
 
 
162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  46.67 
 
 
155 aa  123  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  43.48 
 
 
148 aa  123  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  46.97 
 
 
149 aa  123  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  48.12 
 
 
149 aa  122  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  49.23 
 
 
162 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  41.54 
 
 
146 aa  120  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  38.85 
 
 
146 aa  120  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  43.28 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  40.77 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  43.57 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  44.2 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  46.92 
 
 
164 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  45.45 
 
 
167 aa  118  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0749  response regulator receiver protein  42.14 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  45.38 
 
 
151 aa  118  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  45.8 
 
 
145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  44.62 
 
 
160 aa  117  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 
152 aa  117  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  46.92 
 
 
146 aa  117  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  44.44 
 
 
151 aa  117  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  46.15 
 
 
155 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  45.11 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  44.6 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  43.88 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  44.62 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1247  response regulator receiver protein  50.88 
 
 
140 aa  115  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  42.45 
 
 
157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2026  response regulator receiver protein  45.99 
 
 
154 aa  114  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  40.88 
 
 
151 aa  113  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>