More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2342 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  100 
 
 		 143 aa  285  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  85.92 
 
 		 144 aa  248  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  75.35 
 
 		 148 aa  220  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  78.1 
 
 		 145 aa  218  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  76.81 
 
 		 149 aa  217  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  76.98 
 
 		 146 aa  213  7e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  76.26 
 
 		 145 aa  211  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  74.64 
 
 		 165 aa  210  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  74.24 
 
 		 146 aa  206  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  69.34 
 
 		 146 aa  197  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  67.86 
 
 		 148 aa  196  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  66.43 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  66.43 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  66.43 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  67.88 
 
 		 146 aa  194  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  60.28 
 
 		 148 aa  193  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  66.91 
 
 		 146 aa  191  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  67.63 
 
 		 149 aa  189  8e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  64.75 
 
 		 139 aa  189  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  61.59 
 
 		 139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  61.43 
 
 		 146 aa  186  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  63.5 
 
 		 150 aa  185  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  62.59 
 
 		 154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  62.77 
 
 		 150 aa  181  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  62.77 
 
 		 150 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  62.77 
 
 		 150 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  62.77 
 
 		 150 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  62.77 
 
 		 150 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  62.77 
 
 		 150 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  62.77 
 
 		 150 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  62.77 
 
 		 150 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  62.59 
 
 		 150 aa  180  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  62.94 
 
 		 145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  62.5 
 
 		 154 aa  179  9.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  53.9 
 
 		 146 aa  176  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  59.71 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  61.27 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  57.25 
 
 		 148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  54.23 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  59.15 
 
 		 144 aa  167  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  53.28 
 
 		 148 aa  164  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  60.87 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  57.89 
 
 		 181 aa  160  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  53.52 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  52.08 
 
 		 150 aa  155  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  52.45 
 
 		 151 aa  153  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  48.18 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  52.59 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  49.64 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  52.17 
 
 		 145 aa  147  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  51.09 
 
 		 147 aa  147  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  51.09 
 
 		 147 aa  147  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  46.53 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  47.92 
 
 		 152 aa  140  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  46.15 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  49.64 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  47.55 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  51.09 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  51.09 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  47.1 
 
 		 151 aa  133  8e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  47.83 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  43.88 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  45.77 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  43.26 
 
 		 145 aa  127  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  45.77 
 
 		 146 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1095  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 171 aa  125  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  49.26 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  47.59 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  42.86 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  46.76 
 
 		 147 aa  123  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0524  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 155 aa  123  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  46.32 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0749  response regulator receiver protein  45.14 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  45.93 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  47.76 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  45.59 
 
 		 155 aa  120  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  38.85 
 
 		 146 aa  120  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4797  response regulator receiver protein  44.2 
 
 		 150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.474617  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  43.07 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  45.26 
 
 		 173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  44.2 
 
 		 145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  39.86 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1954  response regulator receiver protein  44.6 
 
 		 151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  44.93 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  42.45 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  44.53 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  43.07 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  43.88 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  45.74 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3985  response regulator receiver protein  42.22 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  44.7 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  45 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  38.41 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  41.55 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  41.01 
 
 		 149 aa  114  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  45.45 
 
 		 151 aa  114  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 143 aa  113  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  44.6 
 
 		 146 aa  113  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>