More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1420 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  100 
 
 
143 aa  293  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  69.23 
 
 
143 aa  207  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  58.7 
 
 
143 aa  165  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  51.06 
 
 
141 aa  147  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  51.77 
 
 
141 aa  147  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  49.64 
 
 
137 aa  137  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  47.45 
 
 
137 aa  133  9e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  47.45 
 
 
137 aa  131  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  49.62 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3604  response regulator receiver  46.1 
 
 
144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3951  response regulator  45.32 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  43.36 
 
 
150 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0903  response regulator receiver protein  44.93 
 
 
143 aa  122  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24539  decreased coverage  0.00652104 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  45.45 
 
 
145 aa  121  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  45.19 
 
 
150 aa  120  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  45.19 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  45.19 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  45.19 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  45.19 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  45.19 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  45.19 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  45.19 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  42.34 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  44.36 
 
 
145 aa  115  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  40.88 
 
 
148 aa  114  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  43.54 
 
 
145 aa  114  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  41.67 
 
 
143 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  42.07 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  41.26 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.54 
 
 
146 aa  110  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  40.14 
 
 
151 aa  110  7.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  42.22 
 
 
148 aa  110  9e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  38.73 
 
 
148 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  43.18 
 
 
139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  42.96 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  42.42 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  40.91 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  38.81 
 
 
148 aa  108  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  43.08 
 
 
151 aa  108  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  42.42 
 
 
165 aa  107  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  44.68 
 
 
149 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  40.88 
 
 
149 aa  107  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  41.67 
 
 
144 aa  105  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  40.15 
 
 
148 aa  106  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  40.88 
 
 
137 aa  106  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  40.6 
 
 
153 aa  106  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  43.97 
 
 
149 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  42.11 
 
 
152 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  44.78 
 
 
145 aa  105  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  42.34 
 
 
139 aa  104  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  40.29 
 
 
146 aa  104  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  37.86 
 
 
162 aa  104  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  38.81 
 
 
147 aa  103  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  38.81 
 
 
147 aa  103  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  38.81 
 
 
147 aa  103  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  37.86 
 
 
162 aa  103  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  42.11 
 
 
151 aa  103  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  41.98 
 
 
154 aa  103  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  36.23 
 
 
153 aa  102  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  43.7 
 
 
146 aa  103  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  40.56 
 
 
152 aa  103  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  39.31 
 
 
153 aa  102  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  39.23 
 
 
148 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  42.36 
 
 
149 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  42.22 
 
 
181 aa  102  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  41.26 
 
 
148 aa  101  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  38.69 
 
 
146 aa  101  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1215  response regulator receiver protein  38.19 
 
 
153 aa  101  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.125969  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  41.13 
 
 
167 aa  101  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  38.81 
 
 
146 aa  101  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  41.26 
 
 
144 aa  101  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3162  response regulator receiver protein  43.2 
 
 
142 aa  101  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  37.04 
 
 
147 aa  101  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  42.75 
 
 
154 aa  100  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  38.06 
 
 
146 aa  100  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  38.78 
 
 
160 aa  100  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  36.69 
 
 
148 aa  100  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  42.31 
 
 
141 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  41.04 
 
 
150 aa  99.4  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  38.24 
 
 
164 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  39.58 
 
 
148 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  39.01 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  42.31 
 
 
141 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  38.24 
 
 
155 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
153 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  36.03 
 
 
153 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  38.97 
 
 
153 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  40 
 
 
146 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  35.77 
 
 
160 aa  96.7  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  39.72 
 
 
144 aa  96.7  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  38.13 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  36.88 
 
 
153 aa  95.9  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  37.76 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  36.76 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  37.78 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  37.76 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  37.23 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0503  response regulator receiver protein  41.6 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  37.76 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>