More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3248 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  100 
 
 		 148 aa  293  6e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  60.28 
 
 		 143 aa  193  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  60.96 
 
 		 148 aa  192  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  63.83 
 
 		 146 aa  191  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  63.04 
 
 		 149 aa  191  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  63.31 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  64.49 
 
 		 165 aa  191  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  61.87 
 
 		 139 aa  184  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  60.61 
 
 		 146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  62.04 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  59.71 
 
 		 145 aa  179  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  57.55 
 
 		 154 aa  179  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  55.41 
 
 		 154 aa  179  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  57.45 
 
 		 145 aa  179  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  58.99 
 
 		 150 aa  178  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  58.78 
 
 		 148 aa  178  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  59.85 
 
 		 139 aa  176  9e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  56.34 
 
 		 146 aa  175  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  54.93 
 
 		 146 aa  175  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  59.85 
 
 		 150 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  59.85 
 
 		 150 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  59.85 
 
 		 150 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  59.85 
 
 		 150 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  59.85 
 
 		 150 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  55.32 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  59.85 
 
 		 150 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  59.85 
 
 		 150 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  55.32 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  55.32 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  56.03 
 
 		 146 aa  174  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  58.39 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  56.03 
 
 		 146 aa  171  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  58.39 
 
 		 150 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  54.73 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  55.4 
 
 		 146 aa  169  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  55.63 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  55.47 
 
 		 150 aa  166  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  52.52 
 
 		 148 aa  164  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  51.8 
 
 		 153 aa  163  9e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  55.56 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  53.19 
 
 		 149 aa  160  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  55.73 
 
 		 181 aa  159  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  47.48 
 
 		 147 aa  157  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  50.68 
 
 		 144 aa  157  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  53.96 
 
 		 148 aa  155  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  51.82 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  51.82 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  52.52 
 
 		 145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  51.09 
 
 		 148 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  44.97 
 
 		 150 aa  146  8e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  48.94 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  49.64 
 
 		 144 aa  144  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  45.83 
 
 		 151 aa  143  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  48.95 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 152 aa  140  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  49.64 
 
 		 160 aa  138  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  46.38 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  47.1 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  45.77 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1095  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  45.71 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  38.85 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  45 
 
 		 148 aa  126  9.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  45.77 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0524  response regulator receiver protein  45.19 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  39.01 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  45.07 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  45.93 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  41.73 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4797  response regulator receiver protein  44.6 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.474617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  45.19 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  43.88 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  43.38 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  40.43 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  42.34 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  43.88 
 
 		 149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  42.45 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  44.62 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  42.03 
 
 		 149 aa  116  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4530  response regulator receiver protein  44.2 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  43.18 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1954  response regulator receiver protein  43.17 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  43.07 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  38.57 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  40.85 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0749  response regulator receiver protein  42.47 
 
 		 156 aa  113  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2026  response regulator receiver protein  43.17 
 
 		 154 aa  113  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 173 aa  113  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  42.42 
 
 		 149 aa  113  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  41.73 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  44.12 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  43.18 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  40.58 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  40.44 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  37.59 
 
 		 151 aa  110  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3679  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 135 aa  110  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.57333  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  40.58 
 
 		 152 aa  110  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3985  response regulator receiver protein  41.48 
 
 		 152 aa  110  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>