More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4644 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  100 
 
 		 145 aa  289  7e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  68.35 
 
 		 165 aa  192  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  64.75 
 
 		 150 aa  189  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  67.15 
 
 		 149 aa  188  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  65.69 
 
 		 150 aa  186  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  65.69 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  65.69 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  65.69 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  65.69 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  65.69 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  65.69 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  65.69 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  64.29 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  63.12 
 
 		 146 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  62.94 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  59.71 
 
 		 148 aa  179  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  59.85 
 
 		 146 aa  178  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  61.27 
 
 		 145 aa  177  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  62.77 
 
 		 150 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  63.5 
 
 		 139 aa  176  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  61.87 
 
 		 154 aa  175  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  63.97 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  63.04 
 
 		 148 aa  174  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  59.12 
 
 		 139 aa  173  7e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  58.39 
 
 		 148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  64.49 
 
 		 144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  56.03 
 
 		 146 aa  169  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  56.83 
 
 		 148 aa  168  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  53.96 
 
 		 146 aa  166  9e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  63.08 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  60 
 
 		 148 aa  165  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  57.04 
 
 		 148 aa  164  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  55.32 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  56.12 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  56.12 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  56.12 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  55.63 
 
 		 153 aa  161  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  56.74 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  56.2 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  57.55 
 
 		 148 aa  157  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  55.07 
 
 		 148 aa  155  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  57.69 
 
 		 181 aa  154  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  55.32 
 
 		 145 aa  153  9e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  52.55 
 
 		 147 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  52.55 
 
 		 147 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  52.52 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  55.4 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  53.62 
 
 		 146 aa  149  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  52.9 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  48.18 
 
 		 144 aa  147  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  52.14 
 
 		 144 aa  140  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  49.29 
 
 		 150 aa  136  8.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  52.24 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  44.06 
 
 		 151 aa  134  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  52.55 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0524  response regulator receiver protein  48.2 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  51.09 
 
 		 144 aa  133  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  47.55 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  52.55 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1095  response regulator receiver protein  46.81 
 
 		 171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  47.62 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  48.61 
 
 		 145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  46.38 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  48.57 
 
 		 149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  49.64 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  47.14 
 
 		 153 aa  127  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  47.62 
 
 		 152 aa  126  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1954  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 151 aa  125  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  50.36 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  48.18 
 
 		 164 aa  123  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  48.18 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  48.55 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  45.59 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  45.93 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  43.17 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  44.06 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  47.45 
 
 		 153 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  46.62 
 
 		 153 aa  120  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  44.06 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  47.1 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  39.44 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  46.38 
 
 		 149 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  46.38 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4797  response regulator receiver protein  45.65 
 
 		 150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.474617  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  46.04 
 
 		 146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  46.72 
 
 		 153 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  46.72 
 
 		 153 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  46.38 
 
 		 152 aa  117  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0458  response regulator receiver  44.2 
 
 		 151 aa  116  9e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2819  response regulator receiver protein  42.03 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0636821 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3985  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  39.72 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  45.07 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>