More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1247 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1247  response regulator receiver protein  100 
 
 
140 aa  286  7e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  45.67 
 
 
154 aa  117  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  45.67 
 
 
154 aa  115  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  47.83 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  50.88 
 
 
139 aa  115  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  48.44 
 
 
146 aa  114  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3139  response regulator receiver protein  45.59 
 
 
138 aa  113  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  45.59 
 
 
147 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  45.59 
 
 
147 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  45.59 
 
 
147 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  50 
 
 
147 aa  110  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  48.18 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  47.54 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  47.66 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1954  response regulator receiver protein  48.03 
 
 
151 aa  106  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  43.38 
 
 
146 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  44 
 
 
143 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  45.9 
 
 
144 aa  105  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  46.9 
 
 
150 aa  103  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  50.43 
 
 
181 aa  103  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  45.61 
 
 
139 aa  103  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  43.85 
 
 
145 aa  102  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  40.29 
 
 
146 aa  102  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4530  response regulator receiver protein  41.41 
 
 
146 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0524  response regulator receiver protein  43.48 
 
 
155 aa  101  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  45.08 
 
 
165 aa  101  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  43.75 
 
 
145 aa  101  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  41.35 
 
 
155 aa  99.4  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4797  response regulator receiver protein  39.85 
 
 
150 aa  99  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.474617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  42.03 
 
 
148 aa  99  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.69 
 
 
146 aa  98.6  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3679  response regulator receiver protein  42.62 
 
 
135 aa  98.2  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.57333  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  43.86 
 
 
148 aa  97.8  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  42.54 
 
 
148 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3985  response regulator receiver protein  41.6 
 
 
152 aa  97.1  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5237  response regulator receiver protein  40.16 
 
 
136 aa  97.1  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.46611  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  43.2 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  42.5 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  38.17 
 
 
148 aa  94.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1095  response regulator receiver protein  42.31 
 
 
171 aa  94  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  40.35 
 
 
148 aa  93.6  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  39.34 
 
 
146 aa  92.8  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  41.73 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  41.98 
 
 
151 aa  91.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  38.84 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  38.84 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  41.41 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  41.6 
 
 
145 aa  90.1  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  43.09 
 
 
145 aa  89.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  43.33 
 
 
148 aa  89  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  39.39 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  39.29 
 
 
160 aa  87.4  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  40.77 
 
 
148 aa  87  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  40.46 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  40.46 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  40.46 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  40.46 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  39.69 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  40.46 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  40.46 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  40.46 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  42.11 
 
 
162 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  42.59 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  41.94 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  39.47 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1743  response regulator receiver protein  44.8 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  40.31 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  38.89 
 
 
162 aa  84  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  38.28 
 
 
148 aa  83.6  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  34.96 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  38.71 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  37.01 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  35.96 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  40 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  39.66 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  42.48 
 
 
153 aa  80.1  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  39.66 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  37.12 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  38.28 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  40.46 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  39.13 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2026  response regulator receiver protein  43.33 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  39.13 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  37.07 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  36.84 
 
 
153 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  36.84 
 
 
147 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  37.8 
 
 
155 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
157 aa  76.6  0.00000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  37.39 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  37.07 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  37.6 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0458  response regulator receiver  31.97 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  32.37 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  37.72 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  34.38 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  33.08 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  35.09 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  35.96 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>