More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0407 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  100 
 
 
142 aa  283  5.999999999999999e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  46.4 
 
 
154 aa  114  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  43.48 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  47.58 
 
 
139 aa  107  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  42.86 
 
 
145 aa  107  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  43.08 
 
 
149 aa  107  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  43.33 
 
 
144 aa  107  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  44.36 
 
 
165 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  43.61 
 
 
149 aa  104  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  40.91 
 
 
143 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  43.31 
 
 
146 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  44.88 
 
 
145 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  44.96 
 
 
145 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  42.03 
 
 
146 aa  101  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  42.22 
 
 
181 aa  101  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  41.6 
 
 
146 aa  100  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  40.6 
 
 
144 aa  100  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  43.41 
 
 
153 aa  100  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  42.97 
 
 
144 aa  100  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  41.61 
 
 
148 aa  100  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  40.62 
 
 
146 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  42.86 
 
 
146 aa  99  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  45.04 
 
 
147 aa  98.6  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  42.64 
 
 
153 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  42.06 
 
 
144 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.54 
 
 
146 aa  97.1  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  40.62 
 
 
145 aa  97.1  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  38.24 
 
 
147 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  38.24 
 
 
147 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  38.24 
 
 
147 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  40.31 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  40.6 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  38.93 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  40.31 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  43.51 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  39.23 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  42.28 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  46.15 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  41.86 
 
 
153 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  42.64 
 
 
151 aa  94.4  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  40.94 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  40.77 
 
 
145 aa  94.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  47.01 
 
 
153 aa  94  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  39.37 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  43.22 
 
 
167 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4725  response regulator receiver protein  34.92 
 
 
138 aa  92  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  42.5 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  46.02 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  38.24 
 
 
146 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  47.06 
 
 
150 aa  92.8  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  39.53 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0314  histidine kinase  41.22 
 
 
531 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  41.73 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  42.5 
 
 
155 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  40.46 
 
 
150 aa  91.3  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  37.8 
 
 
149 aa  90.5  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  40.46 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0283  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  40.46 
 
 
531 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  38.13 
 
 
149 aa  90.1  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  39.23 
 
 
151 aa  88.6  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  40.8 
 
 
148 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  42.74 
 
 
144 aa  89  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  42.5 
 
 
148 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  42.52 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  34.38 
 
 
146 aa  88.2  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  42.11 
 
 
150 aa  88.6  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  35.61 
 
 
148 aa  88.2  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  40.16 
 
 
162 aa  87.8  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  38.21 
 
 
141 aa  87.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  38.28 
 
 
150 aa  87.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  43.1 
 
 
156 aa  87  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  37.5 
 
 
148 aa  87  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  34.62 
 
 
143 aa  87  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  41.23 
 
 
150 aa  87  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  41.23 
 
 
150 aa  87  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  41.23 
 
 
150 aa  87  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  41.23 
 
 
150 aa  87  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  41.23 
 
 
150 aa  87  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  41.23 
 
 
150 aa  87  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  41.23 
 
 
150 aa  87  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2987  response regulator receiver protein  40.16 
 
 
134 aa  86.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309877  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  39.02 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  42.37 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  41.18 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  41.13 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  41.53 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  35.51 
 
 
160 aa  84.7  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  41.53 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  41.53 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0104  response regulator, putative  40.18 
 
 
129 aa  83.6  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  35.61 
 
 
152 aa  83.6  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  43.36 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  37.78 
 
 
144 aa  83.6  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  36.22 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  35.61 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  34.07 
 
 
148 aa  82  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  35.38 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  38.58 
 
 
151 aa  82  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  35.71 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  37.98 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>