More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3324 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  100 
 
 
143 aa  288  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  57.97 
 
 
143 aa  172  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  58.7 
 
 
143 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  51.47 
 
 
141 aa  142  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  50 
 
 
141 aa  142  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3951  response regulator  48.23 
 
 
140 aa  139  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0903  response regulator receiver protein  48.53 
 
 
143 aa  133  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24539  decreased coverage  0.00652104 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  45.45 
 
 
137 aa  126  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  46.97 
 
 
137 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3604  response regulator receiver  45.52 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  43.18 
 
 
137 aa  123  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  40.15 
 
 
148 aa  121  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  41.98 
 
 
145 aa  114  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1215  response regulator receiver protein  43.28 
 
 
153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.125969  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  39.13 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  42.19 
 
 
150 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  38.85 
 
 
148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  38.62 
 
 
145 aa  110  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  37.88 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  36.36 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3947  response regulator receiver protein  48.36 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  40.88 
 
 
139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  38.3 
 
 
165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3765  response regulator receiver protein  48.36 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3821  response regulator receiver protein  48.36 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  41.48 
 
 
140 aa  108  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  40 
 
 
139 aa  107  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0503  response regulator receiver protein  47.54 
 
 
144 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  40 
 
 
145 aa  107  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  39.26 
 
 
154 aa  106  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  44.62 
 
 
151 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  37.98 
 
 
145 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  41.01 
 
 
149 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  38.41 
 
 
146 aa  104  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  34.04 
 
 
152 aa  103  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  36.3 
 
 
147 aa  103  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  36.3 
 
 
147 aa  103  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  36.3 
 
 
147 aa  103  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3162  response regulator receiver protein  40.98 
 
 
142 aa  102  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  42.34 
 
 
145 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  39.1 
 
 
154 aa  103  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  35.88 
 
 
149 aa  102  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  37.23 
 
 
149 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0544  response regulator receiver protein  44.26 
 
 
144 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  39.69 
 
 
148 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0543  response regulator receiver protein  43.8 
 
 
144 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  40.77 
 
 
146 aa  101  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  39.69 
 
 
146 aa  101  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
150 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3329  response regulator receiver protein  42.15 
 
 
144 aa  100  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  38.28 
 
 
146 aa  100  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3486  response regulator receiver protein  44.26 
 
 
144 aa  100  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.46 
 
 
146 aa  100  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  36.92 
 
 
144 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  38.41 
 
 
148 aa  100  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  35.11 
 
 
148 aa  100  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  39.39 
 
 
146 aa  100  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  36.23 
 
 
148 aa  99  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  37.32 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
147 aa  98.6  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  34.04 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  38.41 
 
 
149 aa  98.6  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  35.61 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2164  response regulator receiver protein  42.54 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2083  hypothetical protein  42.62 
 
 
139 aa  97.8  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2073  hypothetical protein  41.8 
 
 
139 aa  97.4  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  34.31 
 
 
148 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  35.34 
 
 
145 aa  97.4  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  36.23 
 
 
146 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  37.5 
 
 
150 aa  97.1  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  37.3 
 
 
144 aa  95.9  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0544.1  hypothetical protein  44.85 
 
 
144 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  37.5 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  38.81 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  37.5 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  37.5 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  34.53 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  37.5 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  37.5 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  37.5 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  39.13 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  37.5 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  40.44 
 
 
167 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  35.38 
 
 
146 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  37.86 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  34.88 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  36.03 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  36.03 
 
 
164 aa  94.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  34.62 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  39.69 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  32.35 
 
 
153 aa  94  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  36.03 
 
 
155 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  36.15 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  37.78 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  37.78 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2523  hypothetical protein  40.8 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2376  hypothetical protein  40.8 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  34.78 
 
 
153 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  34.33 
 
 
146 aa  92  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  35.88 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>