More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3218 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 150 aa  305  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  80 
 
 		 150 aa  248  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  66.2 
 
 		 145 aa  207  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  65.97 
 
 		 149 aa  202  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  63.12 
 
 		 152 aa  201  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  63.64 
 
 		 147 aa  196  7e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  64.54 
 
 		 149 aa  194  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  65.03 
 
 		 151 aa  192  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  58.87 
 
 		 149 aa  187  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  56.55 
 
 		 148 aa  181  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  60.43 
 
 		 152 aa  178  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  52.86 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0149  response regulator receiver protein  62.59 
 
 		 149 aa  164  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.549388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0133  response regulator receiver protein  62.59 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  51.43 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  57.35 
 
 		 167 aa  154  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  51.72 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  47.92 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  49.29 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  50.71 
 
 		 153 aa  144  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  50.71 
 
 		 153 aa  145  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  50 
 
 		 153 aa  141  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  49.29 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0166  response regulator receiver protein  48.55 
 
 		 137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  48.98 
 
 		 164 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 160 aa  137  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  48.98 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 153 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 153 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  47.14 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2987  response regulator receiver protein  50.76 
 
 		 134 aa  130  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309877  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3063  response regulator receiver domain-containing protein  44.06 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0907373  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  46.76 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  46.04 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  43.66 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  47.1 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  52.59 
 
 		 146 aa  126  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  47.1 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  43.88 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  47.73 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  44.93 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  44.93 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  45.71 
 
 		 153 aa  124  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  45.32 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 146 aa  123  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0104  response regulator, putative  50.38 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  43.48 
 
 		 148 aa  120  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  42.14 
 
 		 149 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  41.43 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  43.57 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  45.26 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2287  response regulator  48.44 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  41.3 
 
 		 145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5014  response regulator receiver protein  45.24 
 
 		 138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  41.43 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  41.3 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  39.85 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  44.03 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  40.29 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  40.29 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  40.29 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  42.45 
 
 		 146 aa  110  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  40.6 
 
 		 146 aa  110  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  38.78 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0130  response regulator receiver protein  47.1 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.29 
 
 		 146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  42.03 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  42.65 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0147  response regulator receiver protein  47.1 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  36.62 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  41.3 
 
 		 149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  39.57 
 
 		 154 aa  107  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1549  response regulator receiver protein  37.76 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681265 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  42.03 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  41.01 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  39.86 
 
 		 154 aa  107  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  38.57 
 
 		 141 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  40 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  39.31 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  41.43 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3414  response regulator receiver domain-containing protein  48.89 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  36.96 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  40.29 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  38.57 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  38.62 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  38.85 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  39.57 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  40 
 
 		 145 aa  103  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  38.69 
 
 		 137 aa  103  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  37.76 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>