More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0104 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0104  response regulator, putative  100 
 
 		 129 aa  259  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3414  response regulator receiver domain-containing protein  57.14 
 
 		 139 aa  147  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2987  response regulator receiver protein  52.34 
 
 		 134 aa  134  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  50.38 
 
 		 150 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0166  response regulator receiver protein  45.19 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  50.38 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  50 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  48.12 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  50.82 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  50.85 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0130  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  47.79 
 
 		 147 aa  110  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0147  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 136 aa  110  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  46.51 
 
 		 151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  43.28 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  44.44 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  46.27 
 
 		 151 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  44.03 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  48.78 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  46.92 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  46.21 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  43.94 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2287  response regulator  43.55 
 
 		 136 aa  100  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  43.94 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  42.42 
 
 		 167 aa  99  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  42.15 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  42.64 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0149  response regulator receiver protein  55.08 
 
 		 149 aa  94.7  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.549388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 162 aa  94.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  42.42 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0133  response regulator receiver protein  54.24 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  49.14 
 
 		 146 aa  93.6  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 153 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  42.31 
 
 		 156 aa  92  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2119  response regulator receiver and unknown domain protein  44.8 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  41.41 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  38.35 
 
 		 152 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  38.35 
 
 		 152 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  38.64 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 151 aa  87.8  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  37.98 
 
 		 146 aa  88.2  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3063  response regulator receiver domain-containing protein  41.32 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0907373  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  38.76 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 148 aa  87  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  41.09 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  35.61 
 
 		 148 aa  84.3  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 142 aa  83.6  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 146 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  37.88 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  36.13 
 
 		 1161 aa  81.3  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2099  response regulator receiver  44.8 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.003608 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 154 aa  80.1  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  41.86 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  34.15 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  35.94 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 1937 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2318  response regulator receiver domain-containing protein  31.97 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.824506  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  36.64 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 1161 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 1356 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2064  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1287 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  30.53 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  35.83 
 
 		 1172 aa  77.4  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  38.53 
 
 		 355 aa  77.4  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1203 aa  77  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1869  response regulator receiver protein  31.54 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0826039  normal  0.0620509 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 		 1155 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5014  response regulator receiver protein  38.17 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  36.44 
 
 		 1156 aa  77  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 437 aa  77  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  40.87 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>