More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3414 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3414  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 139 aa  274  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0104  response regulator, putative  57.14 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0166  response regulator receiver protein  45.86 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2987  response regulator receiver protein  47.66 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309877  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  49.23 
 
 		 145 aa  120  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  48.89 
 
 		 150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  50 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0130  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0147  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  48.46 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 149 aa  110  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  45.93 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  48.09 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  50 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  50 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  45.93 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2119  response regulator receiver and unknown domain protein  43.85 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  42.31 
 
 		 148 aa  97.4  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  41.48 
 
 		 167 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  43.85 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  46.51 
 
 		 153 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  45.19 
 
 		 164 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  39.42 
 
 		 146 aa  93.6  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  45.19 
 
 		 155 aa  93.6  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  38.81 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  43.08 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2287  response regulator  39.1 
 
 		 136 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  41.54 
 
 		 153 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  42.31 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  42.31 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  42.31 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0149  response regulator receiver protein  46.51 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.549388  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  39.69 
 
 		 162 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0133  response regulator receiver protein  46.51 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  39.23 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  40.77 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  40.77 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  37.68 
 
 		 150 aa  84.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  40 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  37.12 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  38.93 
 
 		 162 aa  84  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  40 
 
 		 146 aa  83.6  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  35.56 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  34.07 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  32.85 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  34.53 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  39.23 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  41.6 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  40 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5014  response regulator receiver protein  49 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2099  response regulator receiver  40 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.003608 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  33.08 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0314  histidine kinase  37.93 
 
 		 531 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  36.51 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  36.3 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0283  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 531 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  34.56 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  36.3 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  37.9 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  34.09 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  29.2 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  34.33 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  30 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2318  response regulator receiver domain-containing protein  31.76 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.824506  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3063  response regulator receiver domain-containing protein  35 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0907373  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  35.11 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  32.31 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  27.21 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>