More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0147 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0147  response regulator receiver protein  100 
 
 		 136 aa  272  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0130  response regulator receiver protein  96.32 
 
 		 136 aa  263  7e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0166  response regulator receiver protein  48.09 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0104  response regulator, putative  50.83 
 
 		 129 aa  110  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  47.1 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3414  response regulator receiver domain-containing protein  51.67 
 
 		 139 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2987  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309877  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  49.14 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  48.78 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  42.75 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 		 148 aa  93.6  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  44.92 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  42.22 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  44.54 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  47.93 
 
 		 147 aa  90.5  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  47.9 
 
 		 149 aa  90.1  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  41.79 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 153 aa  87  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2287  response regulator  44.07 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 162 aa  84.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 152 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 152 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 146 aa  83.6  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  46.49 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2119  response regulator receiver and unknown domain protein  41.46 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  42.96 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  40.5 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  42.96 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  41.38 
 
 		 150 aa  80.1  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  39.39 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  41.98 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  38.41 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5014  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  37.78 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  39.44 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  39.44 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  31.69 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  39.44 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  31.4 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  38.73 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  37.78 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0133  response regulator receiver protein  38.97 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 1287 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  40 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15460  membrane sensor hybrid histidine protein kinase  37.3 
 
 		 772 aa  70.9  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.361903  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  36.69 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0049  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 142 aa  70.1  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84973  histidine kinase osmosensor Osmolarity two-component system protein SLN1  33.87 
 
 		 1168 aa  70.1  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.656577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.5 
 
 		 1331 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  33.83 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2099  response regulator receiver  41.46 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.003608 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  38.14 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0149  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.549388  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0092  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  33.9 
 
 		 402 aa  69.3  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3063  response regulator receiver domain-containing protein  33.88 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0907373  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  30.97 
 
 		 380 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  38.46 
 
 		 1060 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 		 1959 aa  68.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  36.52 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  33.83 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.09 
 
 		 380 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0930  response regulator  30.09 
 
 		 380 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0994  response regulator  30.09 
 
 		 380 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1161  response regulator  30.09 
 
 		 380 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  34.59 
 
 		 146 aa  67  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  30.09 
 
 		 380 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0856  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0534273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 1622 aa  67  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  30.09 
 
 		 380 aa  66.6  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  30.09 
 
 		 380 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1869  response regulator receiver protein  30.37 
 
 		 169 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0826039  normal  0.0620509 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 		 1110 aa  67  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1070  response regulator  30.09 
 
 		 358 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.209800000000002e-41 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3140  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5953  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0583323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4874  response regulator receiver  32.8 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  30.6 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  34.59 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  31.82 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  32.59 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  37.93 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  35.65 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>