More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_84973 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_84973  histidine kinase osmosensor Osmolarity two-component system protein SLN1  100 
 
 
1168 aa  2392    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.656577  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01800  Two-component system protein B Precursor (EC 2.7.13.3)(Protein NHK1)(SLN1 homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P4U6]  29.2 
 
 
1065 aa  233  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.252305  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.32 
 
 
1788 aa  152  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 
1166 aa  148  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.71 
 
 
946 aa  147  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.88 
 
 
1303 aa  147  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 
1629 aa  146  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0501  histidine kinase  33.69 
 
 
955 aa  145  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1498 aa  144  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 
782 aa  142  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01227  two-component hybrid sensor and regulator  29.7 
 
 
699 aa  141  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 
1316 aa  140  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  31.4 
 
 
785 aa  139  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  29.77 
 
 
778 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0463  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 
1314 aa  135  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332875  normal  0.985136 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1923  response regulator receiver domain-containing protein  29.65 
 
 
569 aa  134  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.285353  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 
909 aa  134  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  30.19 
 
 
914 aa  134  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.53 
 
 
738 aa  133  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.12 
 
 
2213 aa  132  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2282  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.67 
 
 
685 aa  132  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 
876 aa  131  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.37 
 
 
916 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0316  response regulator, histidine kinase  28.83 
 
 
891 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.27 
 
 
977 aa  129  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.89 
 
 
948 aa  127  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.05 
 
 
1245 aa  127  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 
1767 aa  127  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.61 
 
 
1767 aa  127  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2229  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 
1049 aa  127  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664054  normal  0.108682 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2502  sensor histidine kinase/response regulator  26.9 
 
 
676 aa  126  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000989132  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 
770 aa  126  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.69 
 
 
1101 aa  125  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.114215 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.28 
 
 
1313 aa  125  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0066  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 
721 aa  124  8e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 
1767 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4963  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  30.58 
 
 
1122 aa  124  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  29.03 
 
 
1765 aa  123  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0139  histidine kinase  28.84 
 
 
1064 aa  122  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1106  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.89 
 
 
951 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615004  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0053  membrane associated response regulator,histidine kinase  30.32 
 
 
818 aa  122  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.255701  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  27.41 
 
 
1763 aa  122  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1875  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.01 
 
 
705 aa  121  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0416  histidine kinase  28.28 
 
 
896 aa  121  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0480  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 
1686 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.29 
 
 
1326 aa  120  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.33 
 
 
933 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.24 
 
 
1109 aa  119  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_1394  predicted protein  27.47 
 
 
550 aa  119  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  28.42 
 
 
977 aa  119  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1876  histidine kinase  30.18 
 
 
979 aa  119  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0246829  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.98 
 
 
935 aa  119  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.87 
 
 
1768 aa  118  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  29.56 
 
 
918 aa  119  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0482  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.14 
 
 
1681 aa  118  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2151  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 
963 aa  118  6e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614764  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  38.1 
 
 
998 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3839  histidine kinase  27.84 
 
 
590 aa  117  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3210  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.09 
 
 
951 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0082  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.48 
 
 
866 aa  117  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0375698  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3723  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 
903 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.803649  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.16 
 
 
935 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.715392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  29.02 
 
 
1179 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.95 
 
 
1255 aa  116  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  29.2 
 
 
918 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3666  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  27.27 
 
 
1129 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59780  putative kinase sensor protein  30.71 
 
 
1084 aa  115  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000030188  hitchhiker  3.75506e-17 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  34.36 
 
 
659 aa  115  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.82 
 
 
784 aa  115  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.43 
 
 
935 aa  115  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 
764 aa  114  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 
1245 aa  114  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2774  histidine kinase  28.22 
 
 
761 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622194  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.55 
 
 
918 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 
921 aa  112  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4645  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.8 
 
 
948 aa  112  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.42 
 
 
1771 aa  112  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  28.35 
 
 
925 aa  113  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1424  sensor histidine kinase  35.62 
 
 
736 aa  112  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0064  histidine kinase  36.52 
 
 
598 aa  112  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  28.16 
 
 
925 aa  111  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.45 
 
 
918 aa  111  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000544  hypothetical protein  29.27 
 
 
828 aa  111  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2375  histidine kinase  30.3 
 
 
806 aa  111  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.824997  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.45 
 
 
918 aa  111  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.45 
 
 
918 aa  111  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3018  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.64 
 
 
955 aa  110  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0433784  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.45 
 
 
918 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.18 
 
 
790 aa  110  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.45 
 
 
918 aa  111  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  31.13 
 
 
1042 aa  110  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0288  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.99 
 
 
1141 aa  110  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  33.83 
 
 
923 aa  110  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.55 
 
 
682 aa  109  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 
981 aa  108  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2359  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.62 
 
 
949 aa  108  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000333746  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  28.28 
 
 
905 aa  108  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 
1643 aa  108  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3985  signal transduction histidine protein kinase  26.2 
 
 
1156 aa  108  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0386149 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1432  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.62 
 
 
949 aa  108  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0516926  hitchhiker  0.00218938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>