More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2229 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2229  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1049 aa  2151    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664054  normal  0.108682 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 		 1064 aa  363  1e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2282  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.64 
 
 		 685 aa  355  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 		 1767 aa  349  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 1767 aa  349  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 		 1767 aa  349  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0425  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 		 893 aa  349  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  34.75 
 
 		 1763 aa  344  5e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  35.05 
 
 		 1765 aa  342  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0298  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.92 
 
 		 899 aa  337  7e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0542846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 		 745 aa  336  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 1128 aa  335  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.74 
 
 		 1768 aa  330  8e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 		 1784 aa  330  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 		 1782 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 		 1771 aa  327  5e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 		 1786 aa  327  7e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 		 1792 aa  326  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.43 
 
 		 927 aa  327  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 		 1260 aa  326  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2648  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 997 aa  324  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 		 1765 aa  324  5e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  35.95 
 
 		 977 aa  324  6e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.29 
 
 		 1069 aa  323  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 		 833 aa  319  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 		 957 aa  318  3e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  35.28 
 
 		 852 aa  317  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 1287 aa  317  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 948 aa  316  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.41 
 
 		 1582 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.87 
 
 		 946 aa  314  4.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 		 1369 aa  313  6.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 		 757 aa  313  9e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 		 1165 aa  312  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 		 752 aa  313  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 		 1788 aa  313  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.18 
 
 		 568 aa  311  5.9999999999999995e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  36.63 
 
 		 1135 aa  310  6.999999999999999e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 		 816 aa  310  6.999999999999999e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 		 1266 aa  310  6.999999999999999e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.11 
 
 		 2213 aa  310  9e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3595  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.43 
 
 		 744 aa  310  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.79 
 
 		 993 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 		 916 aa  308  4.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 2654 aa  306  9.000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 		 1245 aa  306  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 		 1374 aa  306  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 		 1313 aa  305  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1101 aa  305  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.23 
 
 		 1310 aa  305  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2957  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.62 
 
 		 810 aa  304  7.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 		 1959 aa  303  8.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 		 837 aa  303  9e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00856937  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 		 818 aa  303  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 		 929 aa  301  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 		 1433 aa  300  8e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 1333 aa  300  8e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  35.43 
 
 		 1179 aa  300  9e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000382  putative sensory box sensor histidine kinase/response regulator  31.07 
 
 		 873 aa  299  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 		 1033 aa  299  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 		 1267 aa  298  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  32.12 
 
 		 1364 aa  298  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.2 
 
 		 818 aa  298  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 		 1397 aa  297  6e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 1236 aa  297  8e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 		 770 aa  297  9e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 		 1118 aa  296  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.76 
 
 		 1363 aa  295  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.35 
 
 		 1550 aa  295  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.85 
 
 		 1009 aa  294  6e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  36.57 
 
 		 847 aa  293  9e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  36.84 
 
 		 923 aa  293  9e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 		 1611 aa  293  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 		 1240 aa  292  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 		 778 aa  292  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.15 
 
 		 830 aa  292  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 		 1234 aa  291  4e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2774  histidine kinase  35.34 
 
 		 761 aa  291  4e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.35 
 
 		 1398 aa  291  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 		 1245 aa  291  6e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 		 812 aa  291  7e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 		 1234 aa  290  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0588  ATP-binding region ATPase domain protein  33.9 
 
 		 1068 aa  290  1e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  35.16 
 
 		 1683 aa  289  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.55 
 
 		 1331 aa  288  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 964 aa  288  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  35.7 
 
 		 1177 aa  288  4e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 		 928 aa  288  4e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.84 
 
 		 1238 aa  288  5e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  38.26 
 
 		 850 aa  288  5e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  34.95 
 
 		 1626 aa  288  5e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 1236 aa  287  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 1236 aa  287  7e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 1236 aa  287  7e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 		 1203 aa  287  8e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 1230 aa  287  8e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 		 1238 aa  287  8e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.98 
 
 		 929 aa  287  9e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 		 1238 aa  287  9e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 		 1303 aa  286  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>