More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1875 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1875  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
705 aa  1409    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1951  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.39 
 
 
603 aa  236  8e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2324  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.15 
 
 
1162 aa  232  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 
1079 aa  213  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  35.04 
 
 
589 aa  209  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1413  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.49 
 
 
918 aa  206  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.39 
 
 
1131 aa  204  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.52 
 
 
1101 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  33.75 
 
 
1922 aa  202  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.66 
 
 
1096 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.69 
 
 
869 aa  195  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2986  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 
1228 aa  193  9e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.387618 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1570  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.8 
 
 
1039 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184468  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.09 
 
 
1070 aa  192  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.34 
 
 
1078 aa  190  9e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1424  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.81 
 
 
1050 aa  189  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4662  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  32.86 
 
 
667 aa  189  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0392  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.34 
 
 
762 aa  187  6e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.5363 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.54 
 
 
778 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.3 
 
 
1055 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0257  histidine kinase  45.61 
 
 
847 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.952647  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 
921 aa  182  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.5 
 
 
676 aa  182  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00629905  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0634  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.63 
 
 
1000 aa  182  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.932649  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 
1143 aa  181  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.51 
 
 
902 aa  180  8e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2187  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.15 
 
 
705 aa  180  9e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.58 
 
 
1044 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  45.13 
 
 
742 aa  174  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  31.78 
 
 
977 aa  172  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.84 
 
 
1791 aa  172  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.89 
 
 
1358 aa  171  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1582  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.62 
 
 
788 aa  171  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.63 
 
 
846 aa  171  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2101  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.23 
 
 
678 aa  170  8e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.007905  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  32.06 
 
 
785 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.99 
 
 
940 aa  168  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.22 
 
 
957 aa  167  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.52 
 
 
1199 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 
1193 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 
1193 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.19 
 
 
1005 aa  167  8e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.13 
 
 
767 aa  167  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.44 
 
 
906 aa  166  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  34.11 
 
 
1179 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0973  histidine kinase  43.78 
 
 
733 aa  165  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000797186 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  43.5 
 
 
571 aa  164  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.42 
 
 
1223 aa  164  6e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  41.48 
 
 
559 aa  164  7e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  40.17 
 
 
1193 aa  162  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.8 
 
 
918 aa  161  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.89 
 
 
837 aa  161  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.8 
 
 
918 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  35.68 
 
 
755 aa  160  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.8 
 
 
918 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.8 
 
 
918 aa  161  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.8 
 
 
918 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0064  histidine kinase  41.47 
 
 
598 aa  159  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  40.34 
 
 
1535 aa  159  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  38.22 
 
 
497 aa  158  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.34 
 
 
627 aa  158  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.11 
 
 
907 aa  157  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.67 
 
 
1116 aa  158  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  43.13 
 
 
786 aa  158  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  42.65 
 
 
606 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 
667 aa  157  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.99 
 
 
743 aa  157  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 
974 aa  157  9e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.4 
 
 
947 aa  156  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.47 
 
 
645 aa  156  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.93 
 
 
674 aa  156  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0658  histidine kinase  40 
 
 
627 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1522  histidine kinase  38.84 
 
 
544 aa  154  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  38.22 
 
 
676 aa  154  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 
1075 aa  154  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3693  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.73 
 
 
602 aa  154  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0202  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 
781 aa  154  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0558  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.07 
 
 
893 aa  154  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.843554  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2249  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 
1143 aa  154  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.673162  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  43.91 
 
 
772 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.67 
 
 
1045 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 
902 aa  153  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 
957 aa  153  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.81 
 
 
896 aa  153  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.12 
 
 
1101 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.114215 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 
1223 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 
868 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2452  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 
1177 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0370  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 
1070 aa  152  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 
1070 aa  152  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3492  Cache sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 
1041 aa  151  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  38.57 
 
 
736 aa  151  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2483  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.97 
 
 
1071 aa  150  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.45 
 
 
862 aa  150  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.06 
 
 
827 aa  150  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 
1287 aa  150  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0331  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.43 
 
 
955 aa  150  6e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.383184 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.15 
 
 
1064 aa  150  9e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0107  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 
774 aa  150  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  40.74 
 
 
631 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>