More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2151 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  62.9 
 
 
790 aa  659    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2151  Hpt sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
963 aa  1935    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614764  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.84 
 
 
1643 aa  352  1e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.73 
 
 
944 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 
1452 aa  341  5e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
1195 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.56 
 
 
1229 aa  339  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 
1127 aa  333  9e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  40.04 
 
 
982 aa  321  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  37.84 
 
 
1560 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.71 
 
 
1287 aa  308  4.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.61 
 
 
789 aa  304  6.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.59 
 
 
1767 aa  304  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  37.16 
 
 
968 aa  304  7.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.59 
 
 
1767 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  36.46 
 
 
1060 aa  302  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  43.18 
 
 
735 aa  302  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  39.19 
 
 
1763 aa  301  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  44.15 
 
 
641 aa  301  5e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.64 
 
 
1771 aa  301  5e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.3 
 
 
1768 aa  300  8e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 
932 aa  297  7e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 
1199 aa  296  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  39.95 
 
 
1765 aa  295  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2451  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 
846 aa  295  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414748 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.66 
 
 
827 aa  294  5e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 
1407 aa  294  5e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.24 
 
 
1765 aa  292  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.29 
 
 
1767 aa  292  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.7 
 
 
1786 aa  292  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.7 
 
 
1792 aa  291  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.72 
 
 
1782 aa  291  4e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.3 
 
 
1784 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  40.87 
 
 
631 aa  290  6e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 
1433 aa  290  7e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  41.69 
 
 
631 aa  290  7e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 
1326 aa  290  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 
902 aa  289  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  39.03 
 
 
882 aa  289  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 
1226 aa  289  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.77 
 
 
1135 aa  288  2.9999999999999996e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
724 aa  287  5e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  42.43 
 
 
1023 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.33 
 
 
1128 aa  286  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.12 
 
 
743 aa  284  6.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 
781 aa  284  7.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  37.36 
 
 
793 aa  283  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.62 
 
 
940 aa  283  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.43 
 
 
1313 aa  283  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.28 
 
 
1266 aa  282  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.81 
 
 
765 aa  283  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  39.91 
 
 
661 aa  283  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 
1222 aa  282  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 
764 aa  282  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  41.73 
 
 
620 aa  281  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
1204 aa  281  6e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  39.29 
 
 
671 aa  280  6e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  40.43 
 
 
655 aa  280  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  34.51 
 
 
751 aa  280  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.59 
 
 
1110 aa  279  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
947 aa  279  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.24 
 
 
1363 aa  278  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.18 
 
 
1350 aa  278  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.44 
 
 
973 aa  278  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 
717 aa  278  5e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 
817 aa  276  9e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 
907 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  39.27 
 
 
1135 aa  276  2.0000000000000002e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 
1029 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  38.55 
 
 
544 aa  276  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.95 
 
 
1064 aa  276  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  40.28 
 
 
1028 aa  275  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  42.14 
 
 
853 aa  275  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.84 
 
 
882 aa  274  6e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.96 
 
 
860 aa  274  7e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.69 
 
 
631 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.41 
 
 
2213 aa  273  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2324  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 
1162 aa  273  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1611 aa  273  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2176  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.55 
 
 
1007 aa  272  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.76 
 
 
762 aa  273  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 
995 aa  273  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  39.95 
 
 
589 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1346  PAS sensor protein  40.24 
 
 
803 aa  271  2.9999999999999997e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
1059 aa  271  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  35.89 
 
 
835 aa  271  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  39.19 
 
 
847 aa  271  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.86 
 
 
878 aa  271  4e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.76 
 
 
1245 aa  271  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.27 
 
 
853 aa  271  5e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.1 
 
 
785 aa  271  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3563  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 
1023 aa  271  5e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  40.05 
 
 
578 aa  271  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1246  histidine kinase  36.84 
 
 
762 aa  271  5.9999999999999995e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124717  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.88 
 
 
1548 aa  270  7e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.95 
 
 
918 aa  270  8e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.38 
 
 
1622 aa  270  8.999999999999999e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 
1284 aa  270  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 
785 aa  270  8.999999999999999e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29290  hybrid histidine protein kinase  41.92 
 
 
826 aa  270  8.999999999999999e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>