More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4963 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_4963  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  100 
 
 
1122 aa  2276    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3749  histidine kinase  33.7 
 
 
935 aa  363  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 
936 aa  353  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0749319  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0736  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 
1074 aa  350  8e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3015  kinase sensor protein  34.79 
 
 
936 aa  337  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.162793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3040  histidine kinase  35.23 
 
 
1053 aa  326  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0526469  normal  0.364658 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59780  putative kinase sensor protein  34.65 
 
 
1084 aa  326  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000030188  hitchhiker  3.75506e-17 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0738  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 
925 aa  325  4e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59800  kinase sensor protein  34.41 
 
 
931 aa  318  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000197458  hitchhiker  2.65975e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3017  RcsC  34.73 
 
 
1083 aa  317  7e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2367  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  30.92 
 
 
949 aa  313  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000101959  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2519  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  30.92 
 
 
949 aa  313  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000827535  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02145  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  30.92 
 
 
933 aa  312  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1440  histidine kinase  30.92 
 
 
949 aa  312  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00541515  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02104  hypothetical protein  30.92 
 
 
933 aa  312  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3358  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  30.92 
 
 
949 aa  312  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00504503  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2359  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  30.92 
 
 
949 aa  312  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000333746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1432  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  30.92 
 
 
949 aa  312  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0516926  hitchhiker  0.00218938 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0720  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  30.92 
 
 
949 aa  311  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00107574  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3018  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  32.67 
 
 
955 aa  311  5.9999999999999995e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0433784  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1040  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  30.3 
 
 
934 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3210  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  30.53 
 
 
951 aa  308  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1622  capsular synthesis two-component sensor kinase and response regulator transcription regulator protein  29.75 
 
 
1098 aa  307  9.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1106  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.07 
 
 
951 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615004  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2798  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  29.39 
 
 
949 aa  303  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000245809  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2511  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  29.94 
 
 
948 aa  301  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0476144 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2765  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.33 
 
 
949 aa  301  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.266073  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1308  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.33 
 
 
949 aa  301  4e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00392012  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2456  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  29.94 
 
 
948 aa  301  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.290959  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2497  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  29.94 
 
 
948 aa  301  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147984  normal  0.803827 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2844  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.33 
 
 
957 aa  301  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.436473  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2407  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  29.94 
 
 
948 aa  301  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000239257  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2615  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  29.94 
 
 
915 aa  300  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.544475 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3751  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
1070 aa  299  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3268  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.22 
 
 
957 aa  296  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00176531  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.1 
 
 
1768 aa  293  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  32.78 
 
 
1763 aa  293  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2021  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 
1082 aa  289  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2224  putative two-component regulatory system, sensor kinase protein  31.35 
 
 
1082 aa  289  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2077  sensor histidine kinase/response regulator  31.35 
 
 
1082 aa  289  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.981024  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 
1765 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5219  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 
1029 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5151  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 
1022 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 
1771 aa  284  6.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  34.73 
 
 
1765 aa  284  7.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 
1767 aa  283  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2882  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.62 
 
 
1032 aa  280  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  34.16 
 
 
1255 aa  280  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 
1767 aa  279  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 
1767 aa  277  7e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4966  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  37.9 
 
 
951 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.292915 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0633  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 
1480 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461456  normal  0.141694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3285  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 
1034 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347424  normal  0.554381 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4605  histidine protein kinase  36.89 
 
 
1309 aa  275  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.292459  normal  0.0589738 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
916 aa  274  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.08 
 
 
1002 aa  274  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  35.97 
 
 
785 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  35.8 
 
 
1177 aa  272  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3666  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  28.49 
 
 
1129 aa  272  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 
1397 aa  272  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3985  signal transduction histidine protein kinase  29.64 
 
 
1156 aa  273  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0386149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.95 
 
 
782 aa  273  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0358  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.94 
 
 
1485 aa  272  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3078  histidine kinase  32.6 
 
 
774 aa  272  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.398115 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  35.69 
 
 
1188 aa  271  5.9999999999999995e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 
758 aa  268  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 
1236 aa  269  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 
1236 aa  269  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 
1236 aa  269  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.42 
 
 
1784 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  35.28 
 
 
785 aa  268  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  35.05 
 
 
785 aa  268  5e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.27 
 
 
957 aa  268  5.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 
1303 aa  266  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 
745 aa  266  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 
1782 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 
1238 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 
1238 aa  265  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  34.92 
 
 
785 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  30.1 
 
 
1626 aa  265  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 
977 aa  265  4e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 
1238 aa  265  4e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01579  Response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like protein  34.24 
 
 
891 aa  265  4.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4255  PAS/PAC sensor, hybrid histidine kinase  36.41 
 
 
1418 aa  265  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377123  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 
1238 aa  265  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.85 
 
 
1786 aa  264  6e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4222  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 
1002 aa  263  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480663  normal  0.970552 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5043  PAS  35.95 
 
 
855 aa  263  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.563138  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
1582 aa  263  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4067  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
1490 aa  263  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4693  histidine kinase  27.71 
 
 
1120 aa  262  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.027571  hitchhiker  0.0000750184 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
1305 aa  262  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 
929 aa  262  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.89 
 
 
1233 aa  262  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  33.13 
 
 
1001 aa  262  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0288  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 
1141 aa  262  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  33.12 
 
 
1135 aa  262  3e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.21 
 
 
1442 aa  262  3e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  33.71 
 
 
765 aa  261  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.34 
 
 
933 aa  261  7e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>