More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0100 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  100 
 
 		 141 aa  293  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0384  response regulator receiver protein  50 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  39.71 
 
 		 145 aa  106  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  38.35 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  37.04 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  38.13 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 147 aa  98.6  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  38.35 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  35 
 
 		 149 aa  97.1  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  34.07 
 
 		 148 aa  97.1  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  37.41 
 
 		 151 aa  96.7  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  39.01 
 
 		 149 aa  96.7  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  37.31 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  32.85 
 
 		 147 aa  94  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 149 aa  93.6  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  34.81 
 
 		 150 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  34.06 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 153 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  34.06 
 
 		 153 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  36.88 
 
 		 145 aa  90.5  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 153 aa  88.6  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 156 aa  88.6  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  34.33 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  34.53 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  32.37 
 
 		 151 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  35.07 
 
 		 165 aa  87.8  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  34.33 
 
 		 139 aa  88.2  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 155 aa  87.8  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  36.96 
 
 		 150 aa  87.4  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  35.29 
 
 		 143 aa  87.4  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  32.86 
 
 		 146 aa  87  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  32.86 
 
 		 148 aa  87  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 163 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 149 aa  86.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  34.07 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5014  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 162 aa  85.5  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  27.61 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 167 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  31.54 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 162 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  34.53 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  32.33 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  36.57 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 147 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 147 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 150 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  32.86 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  33.82 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0149  response regulator receiver protein  39.57 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.549388  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  35.61 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  30.5 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2987  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309877  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  29.85 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  31.16 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0749  response regulator receiver protein  35 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  30.6 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  30.5 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  32.09 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  31.58 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  32.35 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1599  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  28.79 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0133  response regulator receiver protein  32.37 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  33.82 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3063  response regulator receiver domain-containing protein  32.37 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0907373  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  27.74 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  28.99 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  30.37 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  28.79 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  27.66 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>