More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2987 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2987  response regulator receiver protein  100 
 
 		 134 aa  267  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309877  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0166  response regulator receiver protein  56.25 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0104  response regulator, putative  52.34 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  50.76 
 
 		 150 aa  130  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  49.61 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  45.19 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  46.51 
 
 		 149 aa  123  8.000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3414  response regulator receiver domain-containing protein  47.66 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  48.84 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  44.7 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  47.62 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  43.85 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  48.06 
 
 		 151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  47.29 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2287  response regulator  45.04 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  45.74 
 
 		 146 aa  110  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  45.08 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0149  response regulator receiver protein  52.38 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.549388  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  42.64 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0130  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0133  response regulator receiver protein  51.59 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0147  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 136 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  42.64 
 
 		 167 aa  101  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  41.86 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  41.86 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  41.86 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  40.31 
 
 		 164 aa  98.6  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  41.09 
 
 		 153 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  40.31 
 
 		 155 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  37.69 
 
 		 156 aa  96.7  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  39.53 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  39.53 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  38.06 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3063  response regulator receiver domain-containing protein  40.48 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0907373  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 162 aa  94  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  38.64 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  38.28 
 
 		 160 aa  91.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  40.31 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  38.76 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  37.21 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  37.21 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 153 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  39.02 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  35.66 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  35.66 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  35.16 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  38.17 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2119  response regulator receiver and unknown domain protein  43.48 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.66 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  32.58 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  37.39 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  33.08 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  30.23 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  30.71 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  30.28 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  33.83 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  32.81 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  32.31 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5014  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  35.43 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  35.09 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  32.81 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  33.86 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  33.59 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>