More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2287 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2287  response regulator  100 
 
 		 136 aa  270  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0166  response regulator receiver protein  46.32 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  47.66 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  48.44 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2987  response regulator receiver protein  45.04 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309877  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  47.29 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  45.74 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  42.64 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  46.15 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  41.86 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  43.85 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  42.64 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0104  response regulator, putative  43.55 
 
 		 129 aa  100  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  46.46 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  37.8 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  37.8 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  44.62 
 
 		 147 aa  94.7  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  44.09 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  42.97 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  41.35 
 
 		 167 aa  93.6  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  41.73 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3414  response regulator receiver domain-containing protein  39.1 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  39.85 
 
 		 146 aa  88.2  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  45.97 
 
 		 145 aa  88.2  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  39.23 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  41.35 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  41.53 
 
 		 146 aa  87  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 146 aa  87  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  35.66 
 
 		 144 aa  87.4  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  41.27 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.27 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  40.6 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 150 aa  84.7  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  40.94 
 
 		 160 aa  84.3  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0147  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0130  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2119  response regulator receiver and unknown domain protein  39.84 
 
 		 131 aa  83.6  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  38.64 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  33.83 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1549  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681265 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  37.8 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  37.8 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  40.31 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  41.41 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  34.62 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  34.88 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  34.88 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  34.88 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  34.88 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  34.88 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  40 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  34.88 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  34.88 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  41.41 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  42.4 
 
 		 154 aa  80.1  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  38.58 
 
 		 150 aa  80.1  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0149  response regulator receiver protein  45.31 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.549388  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  40 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  37.59 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  35.94 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  39.26 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0133  response regulator receiver protein  40.31 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  40.94 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  39.71 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  39.68 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  35.34 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  39.53 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  38.17 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  37.21 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2318  response regulator receiver domain-containing protein  33.11 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.824506  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  37.88 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  37.98 
 
 		 147 aa  76.6  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  39.06 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  37.5 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  38.76 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  36.22 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2099  response regulator receiver  42.19 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.003608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>