More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1549 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1549  response regulator receiver protein  100 
 
 		 146 aa  297  3e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681265 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  59.59 
 
 		 158 aa  174  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0092  response regulator receiver protein  53.42 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  55.24 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1869  response regulator receiver protein  48.39 
 
 		 169 aa  154  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0826039  normal  0.0620509 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2318  response regulator receiver domain-containing protein  49.67 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.824506  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  46.43 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2429  response regulator receiver  48.59 
 
 		 147 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148987  normal  0.0115223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3022  response regulator receiver domain-containing protein  48.94 
 
 		 147 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0049  response regulator receiver protein  50.36 
 
 		 147 aa  140  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2871  response regulator receiver domain-containing protein  48.92 
 
 		 146 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281893  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1755  response regulator receiver  47.92 
 
 		 146 aa  140  7e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131899  normal  0.135934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2711  response regulator receiver protein  50 
 
 		 147 aa  139  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.50358  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2785  response regulator receiver protein  46.62 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5953  response regulator receiver protein  47.1 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0583323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4874  response regulator receiver  47.1 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5415  response regulator receiver protein  47.1 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.729389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2191  response regulator receiver domain-containing protein  44.83 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5359  response regulator receiver protein  43.66 
 
 		 148 aa  134  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0385  two component response regulator  46.76 
 
 		 145 aa  134  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2334  response regulator receiver protein  48.2 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0299  response regulator receiver protein  46.72 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524886  hitchhiker  0.00620929 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1342  response regulator receiver protein  49.64 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4218  putative two-component response regulator/receiver (CheY-like protein)  45.07 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0149  CheY-like receiver protein  46.76 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1782  response regulator receiver protein  46.76 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.750495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  39.86 
 
 		 145 aa  113  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  42.55 
 
 		 167 aa  113  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  42.75 
 
 		 149 aa  110  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  42.65 
 
 		 153 aa  110  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  42.45 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  41.73 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  37.76 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  40.44 
 
 		 153 aa  107  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  38.46 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.78 
 
 		 146 aa  103  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  37.32 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  38.13 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  37.86 
 
 		 153 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  36.5 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  36.5 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  36.5 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  37.06 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  39.26 
 
 		 145 aa  98.6  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  37.31 
 
 		 146 aa  98.6  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  38.52 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  37.69 
 
 		 151 aa  98.2  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  36.03 
 
 		 162 aa  97.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  37.16 
 
 		 156 aa  97.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  38.64 
 
 		 160 aa  97.4  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  36.03 
 
 		 162 aa  97.1  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  37.68 
 
 		 149 aa  97.1  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  36.17 
 
 		 165 aa  97.1  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 146 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  39.1 
 
 		 164 aa  96.7  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  35.07 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  39.1 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  37.23 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  40.94 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  40.94 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  34.81 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  37.68 
 
 		 148 aa  94.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0501  response regulator receiver domain-containing protein  36.69 
 
 		 141 aa  94.7  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  38.35 
 
 		 148 aa  94.7  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  34.72 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  38.28 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  36.09 
 
 		 148 aa  93.6  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  33.57 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  34.56 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  36.03 
 
 		 153 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  36.15 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  39.53 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  30 
 
 		 146 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  33.85 
 
 		 146 aa  90.5  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  34.33 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  36.23 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  37.69 
 
 		 148 aa  90.1  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  35.51 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  38.97 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  32.87 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  35.42 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  31.58 
 
 		 148 aa  87.8  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  34.81 
 
 		 137 aa  88.2  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  34.78 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 150 aa  87  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>