More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4218 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4218  putative two-component response regulator/receiver (CheY-like protein)  100 
 
 		 145 aa  298  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2191  response regulator receiver domain-containing protein  84.72 
 
 		 146 aa  238  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2871  response regulator receiver domain-containing protein  82.76 
 
 		 146 aa  236  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281893  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1755  response regulator receiver  82.64 
 
 		 146 aa  231  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131899  normal  0.135934 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3022  response regulator receiver domain-containing protein  82.39 
 
 		 147 aa  231  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2711  response regulator receiver protein  81.69 
 
 		 147 aa  231  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.50358  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2429  response regulator receiver  81.69 
 
 		 147 aa  230  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148987  normal  0.0115223 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  73.91 
 
 		 148 aa  216  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2334  response regulator receiver protein  73.24 
 
 		 145 aa  209  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0299  response regulator receiver protein  75.54 
 
 		 144 aa  202  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524886  hitchhiker  0.00620929 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5953  response regulator receiver protein  73.05 
 
 		 145 aa  200  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0583323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4874  response regulator receiver  75.36 
 
 		 148 aa  200  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5359  response regulator receiver protein  75.36 
 
 		 148 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5415  response regulator receiver protein  74.64 
 
 		 148 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.729389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0149  CheY-like receiver protein  74.64 
 
 		 145 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1782  response regulator receiver protein  74.64 
 
 		 145 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.750495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2785  response regulator receiver protein  73.38 
 
 		 150 aa  196  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0385  two component response regulator  72.46 
 
 		 145 aa  196  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1342  response regulator receiver protein  73.91 
 
 		 145 aa  190  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  46.26 
 
 		 162 aa  150  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0049  response regulator receiver protein  53.62 
 
 		 147 aa  143  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  48.92 
 
 		 158 aa  143  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1549  response regulator receiver protein  45.07 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681265 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1869  response regulator receiver protein  42.58 
 
 		 169 aa  140  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0826039  normal  0.0620509 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2318  response regulator receiver domain-containing protein  43.14 
 
 		 167 aa  140  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.824506  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0092  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  40.56 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  37.86 
 
 		 149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0501  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  36.5 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  32.87 
 
 		 160 aa  100  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  36.17 
 
 		 154 aa  100  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  37.5 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  35.46 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 155 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  31.65 
 
 		 162 aa  98.6  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  34.04 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  32.87 
 
 		 146 aa  97.8  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  32.87 
 
 		 143 aa  97.4  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  31.65 
 
 		 162 aa  97.4  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  36.09 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  36.17 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  34.25 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  35.21 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  34.56 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  38.03 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 150 aa  93.6  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  32.17 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  32.88 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  38.13 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  30.07 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 143 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  32.87 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  34.06 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  30.77 
 
 		 146 aa  90.9  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  38.46 
 
 		 139 aa  90.9  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 147 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  35.97 
 
 		 150 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  36.81 
 
 		 150 aa  90.5  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  32.86 
 
 		 148 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  33.82 
 
 		 137 aa  90.1  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  32.86 
 
 		 148 aa  88.6  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  33.59 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  33.08 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  31.65 
 
 		 146 aa  88.2  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 148 aa  88.2  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 145 aa  87.8  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  34.53 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  32.65 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  35.46 
 
 		 152 aa  87  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 148 aa  87  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.87 
 
 		 146 aa  87  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3630  response regulator receiver protein  32.28 
 
 		 138 aa  87  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536096  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  34.53 
 
 		 146 aa  87  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 153 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  31.62 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  31.16 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  30.66 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>