More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3630 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3630  response regulator receiver protein  100 
 
 		 138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0501  response regulator receiver domain-containing protein  49.61 
 
 		 141 aa  140  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  36.3 
 
 		 153 aa  91.7  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  36.09 
 
 		 143 aa  88.6  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  34.81 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  34.65 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  31.72 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  32.09 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  31.75 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  32.85 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  32.85 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  32.85 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0092  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  34.56 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  36.92 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0385  two component response regulator  34.88 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2318  response regulator receiver domain-containing protein  29.53 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.824506  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  31.34 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  35.88 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1869  response regulator receiver protein  28.76 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0826039  normal  0.0620509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  34.11 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0299  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524886  hitchhiker  0.00620929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2871  response regulator receiver domain-containing protein  35.16 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281893  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  32.85 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2711  response regulator receiver protein  32.81 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.50358  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5415  response regulator receiver protein  36 
 
 		 148 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.729389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0049  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5359  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2785  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3022  response regulator receiver domain-containing protein  35.16 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  35.35 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2429  response regulator receiver  33.59 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148987  normal  0.0115223 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4874  response regulator receiver  36.8 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0149  CheY-like receiver protein  36.22 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1782  response regulator receiver protein  36.22 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.750495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1755  response regulator receiver  32.54 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131899  normal  0.135934 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  31.16 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  34.07 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.09 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  30.53 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  30.53 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  30.53 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  29.77 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  30.53 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  30.53 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  30.53 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  30.53 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4218  putative two-component response regulator/receiver (CheY-like protein)  32.28 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2334  response regulator receiver protein  38.58 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  32.86 
 
 		 149 aa  72  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  30.08 
 
 		 148 aa  72  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1549  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681265 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  29.01 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1342  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  35.94 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  31.54 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  30.83 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.23 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  31.34 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  32.28 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5953  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0583323 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2912  response regulator receiver protein  31.31 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  31.34 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  27.86 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  30 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  30.88 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  31.06 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  28.26 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2191  response regulator receiver domain-containing protein  30.95 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2535  response regulator  31.19 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>